Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms