Protein–RNA interactions for Protein: Q04364

YMR018W, TPR repeat-containing protein YMR018W, yeastyeast

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR018WQ04364 JLP2YMR132C 627 nt0.15□□□□□ -2.39
YMR018WQ04364 SPG3YDR504C 384 nt0.14□□□□□ -2.39
YMR018WQ04364 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt0.14□□□□□ -2.39
YMR018WQ04364 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.13□□□□□ -2.39
YMR018WQ04364 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.12□□□□□ -2.39
YMR018WQ04364 snR48snR48 113 nt0.11□□□□□ -2.39
YMR018WQ04364 YJL150WYJL150W 303 nt0.09□□□□□ -2.4
YMR018WQ04364 EST1YLR233C 2100 nt0.09□□□□□ -2.4
YMR018WQ04364 snR45snR45 172 nt0.09□□□□□ -2.4
YMR018WQ04364 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt0.07□□□□□ -2.4
YMR018WQ04364 snR39BsnR39B 96 nt0.07□□□□□ -2.4
YMR018WQ04364 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.02□□□□□ -2.41
YMR018WQ04364 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt0.02□□□□□ -2.41
YMR018WQ04364 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.02□□□□□ -2.41
YMR018WQ04364 snR128snR128 126 nt0.02□□□□□ -2.41
YMR018WQ04364 YBL053WYBL053W 375 nt0.01□□□□□ -2.41
YMR018WQ04364 YNL198CYNL198C 303 nt0□□□□□ -2.41
YMR018WQ04364 YOR102WYOR102W 351 nt0□□□□□ -2.41
YMR018WQ04364 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.03□□□□□ -2.41
YMR018WQ04364 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.03□□□□□ -2.41
YMR018WQ04364 YGR164WYGR164W 336 nt-0.05□□□□□ -2.42
YMR018WQ04364 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.05□□□□□ -2.42
YMR018WQ04364 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-0.06□□□□□ -2.42
YMR018WQ04364 snR69snR69 101 nt-0.06□□□□□ -2.42
YMR018WQ04364 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-0.06□□□□□ -2.42
YMR018WQ04364 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-0.08□□□□□ -2.42
YMR018WQ04364 YGR151CYGR151C 336 nt-0.09□□□□□ -2.42
YMR018WQ04364 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.1□□□□□ -2.43
YMR018WQ04364 YNL338WYNL338W 159 nt-0.11□□□□□ -2.43
YMR018WQ04364 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.13□□□□□ -2.43
YMR018WQ04364 YNL205CYNL205C 423 nt-0.14□□□□□ -2.43
YMR018WQ04364 RDS3YPR094W 324 nt-0.14□□□□□ -2.43
YMR018WQ04364 YBR178WYBR178W 375 nt-0.14□□□□□ -2.43
YMR018WQ04364 snR50snR50 90 nt-0.16□□□□□ -2.44
YMR018WQ04364 SEC10YLR166C 2616 nt-0.17□□□□□ -2.44
YMR018WQ04364 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.18□□□□□ -2.44
YMR018WQ04364 SBH2YER019C-A 267 nt-0.2□□□□□ -2.44
YMR018WQ04364 YNL337WYNL337W 255 nt-0.21□□□□□ -2.44
YMR018WQ04364 YNL266WYNL266W 420 nt-0.22□□□□□ -2.44
YMR018WQ04364 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.22□□□□□ -2.44
YMR018WQ04364 SOM1YEL059C-A 225 nt-0.23□□□□□ -2.45
YMR018WQ04364 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.23□□□□□ -2.45
YMR018WQ04364 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.23□□□□□ -2.45
YMR018WQ04364 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.24□□□□□ -2.45
YMR018WQ04364 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.25□□□□□ -2.45
YMR018WQ04364 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.26□□□□□ -2.45
YMR018WQ04364 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-0.26□□□□□ -2.45
YMR018WQ04364 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-0.33□□□□□ -2.46
YMR018WQ04364 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-0.34□□□□□ -2.46
YMR018WQ04364 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-0.34□□□□□ -2.46
YMR018WQ04364 snR67snR67 82 nt-0.36□□□□□ -2.47
YMR018WQ04364 Q0032Q0032 291 nt-0.38□□□□□ -2.47
YMR018WQ04364 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.38□□□□□ -2.47
YMR018WQ04364 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-0.38□□□□□ -2.47
YMR018WQ04364 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.44□□□□□ -2.48
YMR018WQ04364 URB1YKL014C 5295 nt-0.45□□□□□ -2.48
YMR018WQ04364 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.45□□□□□ -2.48
YMR018WQ04364 SKI7YOR076C 2244 nt-0.48□□□□□ -2.49
YMR018WQ04364 YLR294CYLR294C 330 nt-0.49□□□□□ -2.49
YMR018WQ04364 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-0.5□□□□□ -2.49
YMR018WQ04364 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-0.51□□□□□ -2.49
YMR018WQ04364 YOR225WYOR225W 330 nt-0.51□□□□□ -2.49
YMR018WQ04364 snR161snR161 161 nt-0.59□□□□□ -2.5
YMR018WQ04364 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-0.6□□□□□ -2.51
YMR018WQ04364 snR33snR33 183 nt-0.66□□□□□ -2.52
YMR018WQ04364 snR81snR81 201 nt-0.67□□□□□ -2.52
YMR018WQ04364 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-0.67□□□□□ -2.52
YMR018WQ04364 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-0.68□□□□□ -2.52
YMR018WQ04364 YNL170WYNL170W 396 nt-0.68□□□□□ -2.52
YMR018WQ04364 RPL41AYDL184C 78 nt-0.69□□□□□ -2.52
YMR018WQ04364 snR47snR47 99 nt-0.7□□□□□ -2.52
YMR018WQ04364 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-0.71□□□□□ -2.52
YMR018WQ04364 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-0.72□□□□□ -2.52
YMR018WQ04364 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-0.73□□□□□ -2.53
YMR018WQ04364 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-0.74□□□□□ -2.53
YMR018WQ04364 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-0.75□□□□□ -2.53
YMR018WQ04364 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.76□□□□□ -2.53
YMR018WQ04364 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-0.77□□□□□ -2.53
YMR018WQ04364 ATP8Q0080 147 nt-0.79□□□□□ -2.54
YMR018WQ04364 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.79□□□□□ -2.54
YMR018WQ04364 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.8□□□□□ -2.54
YMR018WQ04364 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.8□□□□□ -2.54
YMR018WQ04364 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.8□□□□□ -2.54
YMR018WQ04364 snR38snR38 95 nt-0.8□□□□□ -2.54
YMR018WQ04364 snR61snR61 90 nt-0.83□□□□□ -2.54
YMR018WQ04364 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-0.83□□□□□ -2.54
YMR018WQ04364 YNR077CYNR077C 255 nt-0.83□□□□□ -2.54
YMR018WQ04364 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.84□□□□□ -2.54
YMR018WQ04364 snR77snR77 88 nt-0.95□□□□□ -2.56
YMR018WQ04364 Q0092Q0092 141 nt-0.95□□□□□ -2.56
YMR018WQ04364 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.95□□□□□ -2.56
YMR018WQ04364 YKL225WYKL225W 348 nt-0.96□□□□□ -2.56
YMR018WQ04364 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-0.97□□□□□ -2.56
YMR018WQ04364 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.98□□□□□ -2.57
YMR018WQ04364 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.04□□□□□ -2.58
YMR018WQ04364 snR62snR62 100 nt-1.05□□□□□ -2.58
YMR018WQ04364 Q0143Q0143 153 nt-1.07□□□□□ -2.58
YMR018WQ04364 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.1□□□□□ -2.59
YMR018WQ04364 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-1.2□□□□□ -2.6
YMR018WQ04364 YMR326CYMR326C 309 nt-1.2□□□□□ -2.6
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.5 ms