Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms