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Protein–RNA interactions for Protein: P53057
YPS5, Yapsin-5, yeast
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165 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
YPS5
P53057
YBL100W-B
YBL100W-B
5313 nt
0.29
□□□□□ -2.36
YPS5
P53057
tF(GAA)B
tF(GAA)B
73 nt
0.28
□□□□□ -2.36
YPS5
P53057
tF(GAA)F
tF(GAA)F
73 nt
0.28
□□□□□ -2.36
YPS5
P53057
tF(GAA)G
tF(GAA)G
73 nt
0.28
□□□□□ -2.36
YPS5
P53057
tF(GAA)H1
tF(GAA)H1
73 nt
0.28
□□□□□ -2.36
YPS5
P53057
tF(GAA)H2
tF(GAA)H2
73 nt
0.28
□□□□□ -2.36
YPS5
P53057
tF(GAA)M
tF(GAA)M
73 nt
0.28
□□□□□ -2.36
YPS5
P53057
tF(GAA)P1
tF(GAA)P1
73 nt
0.28
□□□□□ -2.36
YPS5
P53057
tF(GAA)P2
tF(GAA)P2
73 nt
0.28
□□□□□ -2.36
YPS5
P53057
YGR146C-A
YGR146C-A
162 nt
0.28
□□□□□ -2.36
YPS5
P53057
FMP27
YLR454W
7887 nt
0.27
□□□□□ -2.37
YPS5
P53057
YKL145W-A
YKL145W-A
93 nt
0.27
□□□□□ -2.37
YPS5
P53057
YLR294C
YLR294C
330 nt
0.27
□□□□□ -2.37
YPS5
P53057
YBR099C
YBR099C
384 nt
0.25
□□□□□ -2.37
YPS5
P53057
RPM2
YML091C
3609 nt
0.22
□□□□□ -2.37
YPS5
P53057
YOR186C-A
YOR186C-A
210 nt
0.21
□□□□□ -2.38
YPS5
P53057
EST1
YLR233C
2100 nt
0.2
□□□□□ -2.38
YPS5
P53057
AI1
Q0050
2505 nt
0.19
□□□□□ -2.38
YPS5
P53057
YOL013W-A
YOL013W-A
192 nt
0.19
□□□□□ -2.38
YPS5
P53057
YNL054W-B
YNL054W-B
5250 nt
0.18
□□□□□ -2.38
YPS5
P53057
YNL205C
YNL205C
423 nt
0.17
□□□□□ -2.38
YPS5
P53057
snR69
snR69
101 nt
0.16
□□□□□ -2.38
YPS5
P53057
PMP2
YEL017C-A
132 nt
0.16
□□□□□ -2.38
YPS5
P53057
YPL060C-A
YPL060C-A
3315 nt
0.16
□□□□□ -2.38
YPS5
P53057
ESP1
YGR098C
4893 nt
0.16
□□□□□ -2.38
YPS5
P53057
SOM1
YEL059C-A
225 nt
0.14
□□□□□ -2.39
YPS5
P53057
YIL071W-A
YIL071W-A
477 nt
0.14
□□□□□ -2.39
YPS5
P53057
YOL014W
YOL014W
375 nt
0.14
□□□□□ -2.39
YPS5
P53057
SOV1
YMR066W
2697 nt
0.14
□□□□□ -2.39
YPS5
P53057
YGR164W
YGR164W
336 nt
0.13
□□□□□ -2.39
YPS5
P53057
YJL077W-A
YJL077W-A
87 nt
0.12
□□□□□ -2.39
YPS5
P53057
YCL001W-B
YCL001W-B
255 nt
0.12
□□□□□ -2.39
YPS5
P53057
SEC10
YLR166C
2616 nt
0.11
□□□□□ -2.39
YPS5
P53057
tQ(UUG)Q
tQ(UUG)Q
76 nt
0.11
□□□□□ -2.39
YPS5
P53057
YCR095W-A
YCR095W-A
159 nt
0.1
□□□□□ -2.39
YPS5
P53057
RDS3
YPR094W
324 nt
0.09
□□□□□ -2.4
YPS5
P53057
tD(GUC)Q
tD(GUC)Q
75 nt
0.08
□□□□□ -2.4
YPS5
P53057
YNL266W
YNL266W
420 nt
0.08
□□□□□ -2.4
YPS5
P53057
YBR178W
YBR178W
375 nt
0.07
□□□□□ -2.4
YPS5
P53057
snR128
snR128
126 nt
0.05
□□□□□ -2.4
YPS5
P53057
THO2
YNL139C
4794 nt
0.05
□□□□□ -2.4
YPS5
P53057
YER078W-A
YER078W-A
165 nt
0.02
□□□□□ -2.41
YPS5
P53057
YLR286W-A
YLR286W-A
135 nt
0.01
□□□□□ -2.41
YPS5
P53057
YNL170W
YNL170W
396 nt
0.01
□□□□□ -2.41
YPS5
P53057
YBR196C-A
YBR196C-A
150 nt
0.01
□□□□□ -2.41
YPS5
P53057
snR50
snR50
90 nt
0
□□□□□ -2.41
YPS5
P53057
YDL159C-B
YDL159C-B
177 nt
-0.01
□□□□□ -2.41
YPS5
P53057
YER090C-A
YER090C-A
90 nt
-0.01
□□□□□ -2.41
YPS5
P53057
ATP8
Q0080
147 nt
-0.03
□□□□□ -2.41
YPS5
P53057
YLR299C-A
YLR299C-A
93 nt
-0.07
□□□□□ -2.42
YPS5
P53057
YML100W-A
YML100W-A
174 nt
-0.08
□□□□□ -2.42
YPS5
P53057
snR45
snR45
172 nt
-0.09
□□□□□ -2.42
YPS5
P53057
Q0092
Q0092
141 nt
-0.11
□□□□□ -2.43
YPS5
P53057
snR67
snR67
82 nt
-0.18
□□□□□ -2.44
YPS5
P53057
YOL083C-A
YOL083C-A
141 nt
-0.18
□□□□□ -2.44
YPS5
P53057
SBH2
YER019C-A
267 nt
-0.2
□□□□□ -2.44
YPS5
P53057
YML054C-A
YML054C-A
159 nt
-0.21
□□□□□ -2.44
YPS5
P53057
YNL103W-A
YNL103W-A
90 nt
-0.21
□□□□□ -2.44
YPS5
P53057
PAU9
YBL108C-A
129 nt
-0.21
□□□□□ -2.44
YPS5
P53057
YBL071C-B
YBL071C-B
99 nt
-0.22
□□□□□ -2.44
YPS5
P53057
snR81
snR81
201 nt
-0.24
□□□□□ -2.45
YPS5
P53057
YAL037C-A
YAL037C-A
93 nt
-0.24
□□□□□ -2.45
YPS5
P53057
YHR180C-B
YHR180C-B
105 nt
-0.26
□□□□□ -2.45
YPS5
P53057
tA(UGC)Q
tA(UGC)Q
76 nt
-0.27
□□□□□ -2.45
YPS5
P53057
SKI7
YOR076C
2244 nt
-0.28
□□□□□ -2.45
YPS5
P53057
snR61
snR61
90 nt
-0.3
□□□□□ -2.46
YPS5
P53057
YGL041C-B
YGL041C-B
183 nt
-0.3
□□□□□ -2.46
YPS5
P53057
YOL164W-A
YOL164W-A
183 nt
-0.3
□□□□□ -2.46
YPS5
P53057
TFB5
YDR079C-A
219 nt
-0.32
□□□□□ -2.46
YPS5
P53057
Q0143
Q0143
153 nt
-0.35
□□□□□ -2.47
YPS5
P53057
YBR109W-A
YBR109W-A
225 nt
-0.38
□□□□□ -2.47
YPS5
P53057
snR47
snR47
99 nt
-0.39
□□□□□ -2.47
YPS5
P53057
YBL100W-C
YBL100W-C
120 nt
-0.4
□□□□□ -2.47
YPS5
P53057
YGR240C-A
YGR240C-A
201 nt
-0.41
□□□□□ -2.48
YPS5
P53057
RPL41A
YDL184C
78 nt
-0.42
□□□□□ -2.48
YPS5
P53057
YBR296C-A
YBR296C-A
120 nt
-0.44
□□□□□ -2.48
YPS5
P53057
snR38
snR38
95 nt
-0.46
□□□□□ -2.48
YPS5
P53057
tS(GCU)Q1
tS(GCU)Q1
86 nt
-0.49
□□□□□ -2.49
YPS5
P53057
snR85
snR85
171 nt
-0.5
□□□□□ -2.49
YPS5
P53057
snR161
snR161
161 nt
-0.51
□□□□□ -2.49
YPS5
P53057
URB1
YKL014C
5295 nt
-0.52
□□□□□ -2.49
YPS5
P53057
YJL113W
YJL113W
4647 nt
-0.54
□□□□□ -2.5
YPS5
P53057
YMR326C
YMR326C
309 nt
-0.56
□□□□□ -2.5
YPS5
P53057
YOR376W-A
YOR376W-A
156 nt
-0.56
□□□□□ -2.5
YPS5
P53057
snR62
snR62
100 nt
-0.57
□□□□□ -2.5
YPS5
P53057
YDR034C-A
YDR034C-A
177 nt
-0.57
□□□□□ -2.5
YPS5
P53057
YKL106C-A
YKL106C-A
120 nt
-0.58
□□□□□ -2.5
YPS5
P53057
YKL225W
YKL225W
348 nt
-0.6
□□□□□ -2.51
YPS5
P53057
YHR217C
YHR217C
462 nt
-0.61
□□□□□ -2.51
YPS5
P53057
YBL109W
YBL109W
336 nt
-0.62
□□□□□ -2.51
YPS5
P53057
snR33
snR33
183 nt
-0.64
□□□□□ -2.51
YPS5
P53057
YHL009W-B
YHL009W-B
5409 nt
-0.7
□□□□□ -2.52
YPS5
P53057
YOR316C-A
YOR316C-A
210 nt
-0.7
□□□□□ -2.52
YPS5
P53057
YLL066W-B
YLL066W-B
171 nt
-0.77
□□□□□ -2.53
YPS5
P53057
YDR524C-A
YDR524C-A
120 nt
-0.78
□□□□□ -2.53
YPS5
P53057
snR77
snR77
88 nt
-0.79
□□□□□ -2.54
YPS5
P53057
snR64
snR64
101 nt
-0.82
□□□□□ -2.54
YPS5
P53057
tT(UGU)G1
tT(UGU)G1
72 nt
-0.82
□□□□□ -2.54
YPS5
P53057
tT(UGU)G2
tT(UGU)G2
72 nt
-0.82
□□□□□ -2.54
YPS5
P53057
tT(UGU)P
tT(UGU)P
72 nt
-0.82
□□□□□ -2.54
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