Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRPC1P48995 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms