Protein–RNA interactions for Protein: P48567

PUS4, tRNA pseudouridine synthase 4, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS4P48567 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.5□□□□□ -2.33
PUS4P48567 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.5□□□□□ -2.33
PUS4P48567 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.5□□□□□ -2.33
PUS4P48567 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.5□□□□□ -2.33
PUS4P48567 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.5□□□□□ -2.33
PUS4P48567 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.5□□□□□ -2.33
PUS4P48567 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.5□□□□□ -2.33
PUS4P48567 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.5□□□□□ -2.33
PUS4P48567 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.5□□□□□ -2.33
PUS4P48567 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.5□□□□□ -2.33
PUS4P48567 RCO1YMR075W 2055 nt0.47□□□□□ -2.33
PUS4P48567 SOM1YEL059C-A 225 nt0.47□□□□□ -2.33
PUS4P48567 YNL205CYNL205C 423 nt0.45□□□□□ -2.34
PUS4P48567 YBR099CYBR099C 384 nt0.44□□□□□ -2.34
PUS4P48567 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.43□□□□□ -2.34
PUS4P48567 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt0.43□□□□□ -2.34
PUS4P48567 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt0.41□□□□□ -2.34
PUS4P48567 FMP27YLR454W 7887 nt0.4□□□□□ -2.35
PUS4P48567 PMP2YEL017C-A 132 nt0.38□□□□□ -2.35
PUS4P48567 YNL170WYNL170W 396 nt0.38□□□□□ -2.35
PUS4P48567 AI1Q0050 2505 nt0.37□□□□□ -2.35
PUS4P48567 EST1YLR233C 2100 nt0.36□□□□□ -2.35
PUS4P48567 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.35□□□□□ -2.35
PUS4P48567 snR69snR69 101 nt0.35□□□□□ -2.35
PUS4P48567 RPM2YML091C 3609 nt0.34□□□□□ -2.35
PUS4P48567 ATP8Q0080 147 nt0.34□□□□□ -2.36
PUS4P48567 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.34□□□□□ -2.36
PUS4P48567 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.34□□□□□ -2.36
PUS4P48567 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt0.31□□□□□ -2.36
PUS4P48567 YNL266WYNL266W 420 nt0.31□□□□□ -2.36
PUS4P48567 IQG1YPL242C 4488 nt0.3□□□□□ -2.36
PUS4P48567 SEC10YLR166C 2616 nt0.3□□□□□ -2.36
PUS4P48567 Q0092Q0092 141 nt0.29□□□□□ -2.36
PUS4P48567 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.28□□□□□ -2.36
PUS4P48567 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.28□□□□□ -2.36
PUS4P48567 YBR178WYBR178W 375 nt0.28□□□□□ -2.36
PUS4P48567 RDS3YPR094W 324 nt0.27□□□□□ -2.37
PUS4P48567 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt0.26□□□□□ -2.37
PUS4P48567 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt0.25□□□□□ -2.37
PUS4P48567 MLP2YIL149C 5040 nt0.17□□□□□ -2.38
PUS4P48567 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt0.16□□□□□ -2.38
PUS4P48567 snR128snR128 126 nt0.16□□□□□ -2.38
PUS4P48567 ESP1YGR098C 4893 nt0.16□□□□□ -2.38
PUS4P48567 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt0.14□□□□□ -2.39
PUS4P48567 THO2YNL139C 4794 nt0.12□□□□□ -2.39
PUS4P48567 SOV1YMR066W 2697 nt0.11□□□□□ -2.39
PUS4P48567 snR50snR50 90 nt0.1□□□□□ -2.39
PUS4P48567 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.09□□□□□ -2.4
PUS4P48567 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.08□□□□□ -2.4
PUS4P48567 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt0.08□□□□□ -2.4
PUS4P48567 snR45snR45 172 nt0.04□□□□□ -2.4
PUS4P48567 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.03□□□□□ -2.4
PUS4P48567 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-0.03□□□□□ -2.41
PUS4P48567 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-0.04□□□□□ -2.42
PUS4P48567 snR67snR67 82 nt-0.09□□□□□ -2.42
PUS4P48567 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.09□□□□□ -2.42
PUS4P48567 snR61snR61 90 nt-0.13□□□□□ -2.43
PUS4P48567 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-0.13□□□□□ -2.43
PUS4P48567 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-0.13□□□□□ -2.43
PUS4P48567 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.13□□□□□ -2.43
PUS4P48567 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.13□□□□□ -2.43
PUS4P48567 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-0.14□□□□□ -2.43
PUS4P48567 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.15□□□□□ -2.43
PUS4P48567 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-0.16□□□□□ -2.44
PUS4P48567 snR81snR81 201 nt-0.17□□□□□ -2.44
PUS4P48567 Q0143Q0143 153 nt-0.17□□□□□ -2.44
PUS4P48567 SBH2YER019C-A 267 nt-0.19□□□□□ -2.44
PUS4P48567 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-0.24□□□□□ -2.45
PUS4P48567 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-0.24□□□□□ -2.45
PUS4P48567 snR85snR85 171 nt-0.29□□□□□ -2.46
PUS4P48567 snR47snR47 99 nt-0.32□□□□□ -2.46
PUS4P48567 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.36□□□□□ -2.47
PUS4P48567 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-0.36□□□□□ -2.47
PUS4P48567 SKI7YOR076C 2244 nt-0.37□□□□□ -2.47
PUS4P48567 RPL41AYDL184C 78 nt-0.37□□□□□ -2.47
PUS4P48567 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-0.42□□□□□ -2.48
PUS4P48567 YMR326CYMR326C 309 nt-0.43□□□□□ -2.48
PUS4P48567 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-0.43□□□□□ -2.48
PUS4P48567 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-0.51□□□□□ -2.49
PUS4P48567 YHR217CYHR217C 462 nt-0.54□□□□□ -2.5
PUS4P48567 URB1YKL014C 5295 nt-0.54□□□□□ -2.5
PUS4P48567 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-0.55□□□□□ -2.5
PUS4P48567 snR62snR62 100 nt-0.56□□□□□ -2.5
PUS4P48567 YBL109WYBL109W 336 nt-0.58□□□□□ -2.5
PUS4P48567 snR38snR38 95 nt-0.6□□□□□ -2.51
PUS4P48567 snR161snR161 161 nt-0.62□□□□□ -2.51
PUS4P48567 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.65□□□□□ -2.51
PUS4P48567 YKL225WYKL225W 348 nt-0.67□□□□□ -2.52
PUS4P48567 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-0.69□□□□□ -2.52
PUS4P48567 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.73□□□□□ -2.53
PUS4P48567 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.73□□□□□ -2.53
PUS4P48567 snR33snR33 183 nt-0.76□□□□□ -2.53
PUS4P48567 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.78□□□□□ -2.53
PUS4P48567 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.78□□□□□ -2.53
PUS4P48567 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.78□□□□□ -2.53
PUS4P48567 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-0.81□□□□□ -2.54
PUS4P48567 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-0.89□□□□□ -2.55
PUS4P48567 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.89□□□□□ -2.55
PUS4P48567 YNR077CYNR077C 255 nt-0.9□□□□□ -2.55
PUS4P48567 snR64snR64 101 nt-0.93□□□□□ -2.56
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