Protein–RNA interactions for Protein: P39925

AFG3, Mitochondrial respiratory chain complexes assembly protein AFG3, yeastyeast

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AFG3P39925 ORC3YLL004W 1851 nt0.44□□□□□ -2.34
AFG3P39925 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.4□□□□□ -2.35
AFG3P39925 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt0.39□□□□□ -2.35
AFG3P39925 YNL337WYNL337W 255 nt0.38□□□□□ -2.35
AFG3P39925 YGR151CYGR151C 336 nt0.35□□□□□ -2.35
AFG3P39925 YDR210WYDR210W 228 nt0.33□□□□□ -2.36
AFG3P39925 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt0.33□□□□□ -2.36
AFG3P39925 YNL198CYNL198C 303 nt0.33□□□□□ -2.36
AFG3P39925 YOR102WYOR102W 351 nt0.32□□□□□ -2.36
AFG3P39925 snR39BsnR39B 96 nt0.32□□□□□ -2.36
AFG3P39925 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.31□□□□□ -2.36
AFG3P39925 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.31□□□□□ -2.36
AFG3P39925 YJL113WYJL113W 4647 nt0.31□□□□□ -2.36
AFG3P39925 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt0.29□□□□□ -2.36
AFG3P39925 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.29□□□□□ -2.36
AFG3P39925 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.29□□□□□ -2.36
AFG3P39925 YBR099CYBR099C 384 nt0.29□□□□□ -2.36
AFG3P39925 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.28□□□□□ -2.36
AFG3P39925 YNL338WYNL338W 159 nt0.28□□□□□ -2.36
AFG3P39925 SOV1YMR066W 2697 nt0.28□□□□□ -2.37
AFG3P39925 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.25□□□□□ -2.37
AFG3P39925 Q0032Q0032 291 nt0.23□□□□□ -2.37
AFG3P39925 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt0.21□□□□□ -2.38
AFG3P39925 snR45snR45 172 nt0.19□□□□□ -2.38
AFG3P39925 YBL053WYBL053W 375 nt0.17□□□□□ -2.38
AFG3P39925 EST1YLR233C 2100 nt0.16□□□□□ -2.38
AFG3P39925 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.14□□□□□ -2.39
AFG3P39925 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.14□□□□□ -2.39
AFG3P39925 YNL205CYNL205C 423 nt0.14□□□□□ -2.39
AFG3P39925 snR128snR128 126 nt0.1□□□□□ -2.39
AFG3P39925 snR69snR69 101 nt0.09□□□□□ -2.4
AFG3P39925 PMP2YEL017C-A 132 nt0.09□□□□□ -2.4
AFG3P39925 SOM1YEL059C-A 225 nt0.09□□□□□ -2.4
AFG3P39925 YOR225WYOR225W 330 nt0.06□□□□□ -2.4
AFG3P39925 RDS3YPR094W 324 nt0.06□□□□□ -2.4
AFG3P39925 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt0.04□□□□□ -2.4
AFG3P39925 YGR164WYGR164W 336 nt0.03□□□□□ -2.4
AFG3P39925 SEC10YLR166C 2616 nt0.03□□□□□ -2.4
AFG3P39925 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt0.02□□□□□ -2.41
AFG3P39925 YLR294CYLR294C 330 nt0.02□□□□□ -2.41
AFG3P39925 YBR178WYBR178W 375 nt0.02□□□□□ -2.41
AFG3P39925 TFB5YDR079C-A 219 nt0.01□□□□□ -2.41
AFG3P39925 YNL266WYNL266W 420 nt0.01□□□□□ -2.41
AFG3P39925 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-0.01□□□□□ -2.41
AFG3P39925 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-0.02□□□□□ -2.41
AFG3P39925 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.04□□□□□ -2.42
AFG3P39925 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.05□□□□□ -2.42
AFG3P39925 snR50snR50 90 nt-0.07□□□□□ -2.42
AFG3P39925 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.08□□□□□ -2.42
AFG3P39925 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-0.1□□□□□ -2.43
AFG3P39925 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.1□□□□□ -2.43
AFG3P39925 SBH2YER019C-A 267 nt-0.11□□□□□ -2.43
AFG3P39925 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.11□□□□□ -2.43
AFG3P39925 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.11□□□□□ -2.43
AFG3P39925 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.12□□□□□ -2.43
AFG3P39925 snR67snR67 82 nt-0.17□□□□□ -2.44
AFG3P39925 YNL170WYNL170W 396 nt-0.17□□□□□ -2.44
AFG3P39925 ATP8Q0080 147 nt-0.25□□□□□ -2.45
AFG3P39925 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-0.25□□□□□ -2.45
AFG3P39925 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-0.26□□□□□ -2.45
AFG3P39925 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.28□□□□□ -2.45
AFG3P39925 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.3□□□□□ -2.46
AFG3P39925 Q0092Q0092 141 nt-0.33□□□□□ -2.46
AFG3P39925 YNR077CYNR077C 255 nt-0.33□□□□□ -2.46
AFG3P39925 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-0.34□□□□□ -2.46
AFG3P39925 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-0.34□□□□□ -2.46
AFG3P39925 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-0.38□□□□□ -2.47
AFG3P39925 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-0.38□□□□□ -2.47
AFG3P39925 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-0.4□□□□□ -2.47
AFG3P39925 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-0.4□□□□□ -2.47
AFG3P39925 SKI7YOR076C 2244 nt-0.4□□□□□ -2.47
AFG3P39925 URB1YKL014C 5295 nt-0.41□□□□□ -2.47
AFG3P39925 snR61snR61 90 nt-0.41□□□□□ -2.48
AFG3P39925 snR81snR81 201 nt-0.41□□□□□ -2.48
AFG3P39925 RPL41AYDL184C 78 nt-0.42□□□□□ -2.48
AFG3P39925 snR47snR47 99 nt-0.45□□□□□ -2.48
AFG3P39925 snR161snR161 161 nt-0.47□□□□□ -2.48
AFG3P39925 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-0.47□□□□□ -2.48
AFG3P39925 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-0.48□□□□□ -2.49
AFG3P39925 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-0.51□□□□□ -2.49
AFG3P39925 Q0143Q0143 153 nt-0.56□□□□□ -2.5
AFG3P39925 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.56□□□□□ -2.5
AFG3P39925 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.56□□□□□ -2.5
AFG3P39925 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.56□□□□□ -2.5
AFG3P39925 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.57□□□□□ -2.5
AFG3P39925 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-0.62□□□□□ -2.51
AFG3P39925 snR33snR33 183 nt-0.62□□□□□ -2.51
AFG3P39925 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-0.64□□□□□ -2.51
AFG3P39925 YMR326CYMR326C 309 nt-0.66□□□□□ -2.52
AFG3P39925 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.66□□□□□ -2.52
AFG3P39925 snR38snR38 95 nt-0.66□□□□□ -2.52
AFG3P39925 snR62snR62 100 nt-0.68□□□□□ -2.52
AFG3P39925 snR85snR85 171 nt-0.68□□□□□ -2.52
AFG3P39925 YKL225WYKL225W 348 nt-0.69□□□□□ -2.52
AFG3P39925 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.72□□□□□ -2.52
AFG3P39925 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.74□□□□□ -2.53
AFG3P39925 YHR217CYHR217C 462 nt-0.76□□□□□ -2.53
AFG3P39925 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.84□□□□□ -2.54
AFG3P39925 YBL109WYBL109W 336 nt-0.87□□□□□ -2.55
AFG3P39925 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-0.9□□□□□ -2.55
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