Protein–RNA interactions for Protein: P38934

BFR1, Nuclear segregation protein BFR1, yeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 470 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BFR1	P38934	snR55	snR55	98 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
BFR1	P38934	snR69	snR69	101 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
BFR1	P38934	YOR170W	YOR170W	306 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
BFR1	P38934	snR49	snR49	165 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
BFR1	P38934	snR33	snR33	183 nt		-0.92	□□□□□ -2.56
BFR1	P38934	YGR146C-A	YGR146C-A	162 nt		-0.93	□□□□□ -2.56
BFR1	P38934	YER090C-A	YER090C-A	90 nt		-0.95	□□□□□ -2.56
BFR1	P38934	snR39B	snR39B	96 nt		-0.95	□□□□□ -2.56
BFR1	P38934	RDS3	YPR094W	324 nt		-0.97	□□□□□ -2.56
BFR1	P38934	PMP2	YEL017C-A	132 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
BFR1	P38934	YNL097C-B	YNL097C-B	123 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
BFR1	P38934	tT(UGU)G1	tT(UGU)G1	72 nt		-1	□□□□□ -2.57
BFR1	P38934	tT(UGU)G2	tT(UGU)G2	72 nt		-1	□□□□□ -2.57
BFR1	P38934	tT(UGU)P	tT(UGU)P	72 nt		-1	□□□□□ -2.57
BFR1	P38934	YOL155W-A	YOL155W-A	135 nt		-1	□□□□□ -2.57
BFR1	P38934	YNL266W	YNL266W	420 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
BFR1	P38934	snR50	snR50	90 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
BFR1	P38934	snR65	snR65	100 nt		-1.02	□□□□□ -2.57
BFR1	P38934	YHR175W-A	YHR175W-A	150 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
BFR1	P38934	YOR329W-A	YOR329W-A	210 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
BFR1	P38934	YPL152W-A	YPL152W-A	99 nt		-1.06	□□□□□ -2.58
BFR1	P38934	YOR302W	YOR302W	78 nt		-1.1	□□□□□ -2.59
BFR1	P38934	tD(GUC)Q	tD(GUC)Q	75 nt		-1.13	□□□□□ -2.59
BFR1	P38934	JLP2	YMR132C	627 nt		-1.13	□□□□□ -2.59
BFR1	P38934	snR56	snR56	88 nt		-1.14	□□□□□ -2.59
BFR1	P38934	tR(ACG)Q2	tR(ACG)Q2	74 nt		-1.14	□□□□□ -2.59
BFR1	P38934	snR48	snR48	113 nt		-1.17	□□□□□ -2.6
BFR1	P38934	snR67	snR67	82 nt		-1.18	□□□□□ -2.6
BFR1	P38934	YGL188C-A	YGL188C-A	141 nt		-1.19	□□□□□ -2.6
BFR1	P38934	YLR286W-A	YLR286W-A	135 nt		-1.19	□□□□□ -2.6
BFR1	P38934	YNL205C	YNL205C	423 nt		-1.19	□□□□□ -2.6
BFR1	P38934	YBR178W	YBR178W	375 nt		-1.23	□□□□□ -2.61
BFR1	P38934	YLR342W-A	YLR342W-A	174 nt		-1.25	□□□□□ -2.61
BFR1	P38934	snR161	snR161	161 nt		-1.25	□□□□□ -2.61
BFR1	P38934	snR52	snR52	92 nt		-1.25	□□□□□ -2.61
BFR1	P38934	YDL159C-B	YDL159C-B	177 nt		-1.26	□□□□□ -2.61
BFR1	P38934	tL(UAA)Q	tL(UAA)Q	85 nt		-1.29	□□□□□ -2.62
BFR1	P38934	YOR102W	YOR102W	351 nt		-1.29	□□□□□ -2.62
BFR1	P38934	SKI7	YOR076C	2244 nt		-1.3	□□□□□ -2.62	RIP-Chip
BFR1	P38934	YOR231C-A	YOR231C-A	201 nt		-1.3	□□□□□ -2.62
BFR1	P38934	tP(UGG)Q	tP(UGG)Q	72 nt		-1.34	□□□□□ -2.62
BFR1	P38934	YDR524W-C	YDR524W-C	90 nt		-1.36	□□□□□ -2.63
BFR1	P38934	snR80	snR80	171 nt		-1.38	□□□□□ -2.63
BFR1	P38934	YHL015W-A	YHL015W-A	84 nt		-1.38	□□□□□ -2.63
BFR1	P38934	YBR223W-A	YBR223W-A	120 nt		-1.38	□□□□□ -2.63
BFR1	P38934	YLR299C-A	YLR299C-A	93 nt		-1.44	□□□□□ -2.64
BFR1	P38934	YBR196C-A	YBR196C-A	150 nt		-1.47	□□□□□ -2.64
BFR1	P38934	YML054C-A	YML054C-A	159 nt		-1.49	□□□□□ -2.65
BFR1	P38934	YDR406W-A	YDR406W-A	246 nt		-1.56	□□□□□ -2.66
BFR1	P38934	YNL198C	YNL198C	303 nt		-1.6	□□□□□ -2.67
BFR1	P38934	YGR240C-A	YGR240C-A	201 nt		-1.69	□□□□□ -2.68
BFR1	P38934	CDC65	tQ(CUG)M	72 nt		-1.7	□□□□□ -2.68
BFR1	P38934	SOM1	YEL059C-A	225 nt		-1.72	□□□□□ -2.68
BFR1	P38934	YHR180C-B	YHR180C-B	105 nt		-1.72	□□□□□ -2.68
BFR1	P38934	YJL150W	YJL150W	303 nt		-1.74	□□□□□ -2.69
BFR1	P38934	tY(GUA)Q	tY(GUA)Q	84 nt		-1.75	□□□□□ -2.69
BFR1	P38934	snR77	snR77	88 nt		-1.76	□□□□□ -2.69
BFR1	P38934	YBL053W	YBL053W	375 nt		-1.77	□□□□□ -2.69
BFR1	P38934	YOR376W-A	YOR376W-A	156 nt		-1.79	□□□□□ -2.7
BFR1	P38934	YCR095W-A	YCR095W-A	159 nt		-1.81	□□□□□ -2.7
BFR1	P38934	YMR046W-A	YMR046W-A	129 nt		-1.87	□□□□□ -2.71
BFR1	P38934	YNR077C	YNR077C	255 nt		-1.89	□□□□□ -2.71
BFR1	P38934	YMR315W-A	YMR315W-A	108 nt		-1.91	□□□□□ -2.72
BFR1	P38934	snR81	snR81	201 nt		-1.94	□□□□□ -2.72
BFR1	P38934	YKL106C-A	YKL106C-A	120 nt		-1.96	□□□□□ -2.72
BFR1	P38934	YOR316C-A	YOR316C-A	210 nt		-1.96	□□□□□ -2.72
BFR1	P38934	SPG3	YDR504C	384 nt		-2.03	□□□□□ -2.73
BFR1	P38934	YBR296C-A	YBR296C-A	120 nt		-2.04	□□□□□ -2.74
BFR1	P38934	Q0142	Q0142	177 nt		-2.05	□□□□□ -2.74
BFR1	P38934	RPL41A	YDL184C	78 nt		-2.06	□□□□□ -2.74
BFR1	P38934	YBR109W-A	YBR109W-A	225 nt		-2.06	□□□□□ -2.74
BFR1	P38934	YGR151C	YGR151C	336 nt		-2.07	□□□□□ -2.74
BFR1	P38934	YOL083C-A	YOL083C-A	141 nt		-2.12	□□□□□ -2.75
BFR1	P38934	tM(CAU)Q1	tM(CAU)Q1	76 nt		-2.14	□□□□□ -2.75
BFR1	P38934	YBL071C-B	YBL071C-B	99 nt		-2.16	□□□□□ -2.76
BFR1	P38934	YOL164W-A	YOL164W-A	183 nt		-2.21	□□□□□ -2.76
BFR1	P38934	snR38	snR38	95 nt		-2.21	□□□□□ -2.76
BFR1	P38934	YCL001W-B	YCL001W-B	255 nt		-2.22	□□□□□ -2.76
BFR1	P38934	YLR466C-B	YLR466C-B	117 nt		-2.26	□□□□□ -2.77
BFR1	P38934	YAL037C-A	YAL037C-A	93 nt		-2.27	□□□□□ -2.77
BFR1	P38934	YOR309C	YOR309C	381 nt		-2.3	□□□□□ -2.78
BFR1	P38934	snR47	snR47	99 nt		-2.33	□□□□□ -2.78
BFR1	P38934	YBL100W-C	YBL100W-C	120 nt		-2.35	□□□□□ -2.79
BFR1	P38934	YNL338W	YNL338W	159 nt		-2.39	□□□□□ -2.79
BFR1	P38934	YBR126W-B	YBR126W-B	144 nt		-2.44	□□□□□ -2.8
BFR1	P38934	YNL337W	YNL337W	255 nt		-2.5	□□□□□ -2.81
BFR1	P38934	snR6	snR6	112 nt		-2.57	□□□□□ -2.82
BFR1	P38934	YKL225W	YKL225W	348 nt		-2.61	□□□□□ -2.83
BFR1	P38934	tS(GCU)Q1	tS(GCU)Q1	86 nt		-2.64	□□□□□ -2.83
BFR1	P38934	YOR335W-A	YOR335W-A	81 nt		-2.7	□□□□□ -2.84
BFR1	P38934	RPL41B	YDL133C-A	78 nt		-2.72	□□□□□ -2.84
BFR1	P38934	YDL114W-A	YDL114W-A	114 nt		-2.75	□□□□□ -2.85
BFR1	P38934	Q0032	Q0032	291 nt		-2.78	□□□□□ -2.85
BFR1	P38934	snR73	snR73	106 nt		-2.78	□□□□□ -2.85
BFR1	P38934	tV(UAC)Q	tV(UAC)Q	76 nt		-2.78	□□□□□ -2.85
BFR1	P38934	YGL041C-B	YGL041C-B	183 nt		-2.8	□□□□□ -2.86
BFR1	P38934	snR61	snR61	90 nt		-2.89	□□□□□ -2.87
BFR1	P38934	snR85	snR85	171 nt		-2.89	□□□□□ -2.87
BFR1	P38934	YDR034C-A	YDR034C-A	177 nt		-2.89	□□□□□ -2.87
BFR1	P38934	YNL103W-A	YNL103W-A	90 nt		-2.9	□□□□□ -2.87

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