Protein–RNA interactions for Protein: P36153

YKR073C, Uncharacterized protein YKR073C, yeastyeast

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR073CP36153 VPS15YBR097W 4365 nt1.46□□□□□ -2.18
YKR073CP36153 PET111YMR257C 2403 nt1.46□□□□□ -2.18
YKR073CP36153 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt1.46□□□□□ -2.18
YKR073CP36153 CAT8YMR280C 4302 nt1.45□□□□□ -2.18
YKR073CP36153 BUL2YML111W 2763 nt1.45□□□□□ -2.18
YKR073CP36153 NUP188YML103C 4968 nt1.45□□□□□ -2.18
YKR073CP36153 BRR2YER172C 6492 nt1.44□□□□□ -2.18
YKR073CP36153 TRM732YMR259C 4263 nt1.43□□□□□ -2.18
YKR073CP36153 SSK2YNR031C 4740 nt1.43□□□□□ -2.18
YKR073CP36153 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.43□□□□□ -2.18
YKR073CP36153 FYV8YGR196C 2454 nt1.43□□□□□ -2.18
YKR073CP36153 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt1.43□□□□□ -2.18
YKR073CP36153 EST2YLR318W 2655 nt1.43□□□□□ -2.18
YKR073CP36153 TMA7YLR262C-A 195 nt1.38□□□□□ -2.19
YKR073CP36153 BST1YFL025C 3090 nt1.37□□□□□ -2.19
YKR073CP36153 MYO1YHR023W 5787 nt1.37□□□□□ -2.19
YKR073CP36153 YJR029WYJR029W 5268 nt1.36□□□□□ -2.19
YKR073CP36153 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.36□□□□□ -2.19
YKR073CP36153 CDC39YCR093W 6327 nt1.35□□□□□ -2.19
YKR073CP36153 LAA1YJL207C 6045 nt1.33□□□□□ -2.2
YKR073CP36153 YER090C-AYER090C-A 90 nt1.32□□□□□ -2.2
YKR073CP36153 YGR130CYGR130C 2451 nt1.26□□□□□ -2.21
YKR073CP36153 CLU1YMR012W 3834 nt1.23□□□□□ -2.21
YKR073CP36153 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt1.23□□□□□ -2.21
YKR073CP36153 SPT7YBR081C 3999 nt1.22□□□□□ -2.21
YKR073CP36153 IML1YJR138W 4755 nt1.21□□□□□ -2.22
YKR073CP36153 snR67snR67 82 nt1.2□□□□□ -2.22
YKR073CP36153 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt1.19□□□□□ -2.22
YKR073CP36153 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.19□□□□□ -2.22
YKR073CP36153 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.19□□□□□ -2.22
YKR073CP36153 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.19□□□□□ -2.22
YKR073CP36153 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.19□□□□□ -2.22
YKR073CP36153 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.19□□□□□ -2.22
YKR073CP36153 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.19□□□□□ -2.22
YKR073CP36153 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.19□□□□□ -2.22
YKR073CP36153 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.16□□□□□ -2.22
YKR073CP36153 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt1.16□□□□□ -2.22
YKR073CP36153 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.15□□□□□ -2.23
YKR073CP36153 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.15□□□□□ -2.23
YKR073CP36153 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.15□□□□□ -2.23
YKR073CP36153 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1.14□□□□□ -2.23
YKR073CP36153 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.14□□□□□ -2.23
YKR073CP36153 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt1.13□□□□□ -2.23
YKR073CP36153 SPC110YDR356W 2835 nt1.11□□□□□ -2.23
YKR073CP36153 VAM6YDL077C 3150 nt1.1□□□□□ -2.23
YKR073CP36153 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt1.1□□□□□ -2.23
YKR073CP36153 RKR1YMR247C 4689 nt1.07□□□□□ -2.24
YKR073CP36153 DOP1YDR141C 5097 nt1.07□□□□□ -2.24
YKR073CP36153 YMR160WYMR160W 2451 nt1.07□□□□□ -2.24
YKR073CP36153 snR40snR40 97 nt1.01□□□□□ -2.25
YKR073CP36153 MLP2YIL149C 5040 nt1.01□□□□□ -2.25
YKR073CP36153 YPR117WYPR117W 7470 nt0.99□□□□□ -2.25
YKR073CP36153 LTE1YAL024C 4308 nt0.97□□□□□ -2.25
YKR073CP36153 SCC2YDR180W 4482 nt0.92□□□□□ -2.26
YKR073CP36153 PAU24YBR301W 363 nt0.92□□□□□ -2.26
YKR073CP36153 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.88□□□□□ -2.27
YKR073CP36153 snR77snR77 88 nt0.82□□□□□ -2.28
YKR073CP36153 BEM2YER155C 6504 nt0.82□□□□□ -2.28
YKR073CP36153 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt0.81□□□□□ -2.28
YKR073CP36153 UTP20YBL004W 7482 nt0.76□□□□□ -2.29
YKR073CP36153 MLP1YKR095W 5628 nt0.76□□□□□ -2.29
YKR073CP36153 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.76□□□□□ -2.29
YKR073CP36153 SBH2YER019C-A 267 nt0.75□□□□□ -2.29
YKR073CP36153 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.72□□□□□ -2.29
YKR073CP36153 THO2YNL139C 4794 nt0.71□□□□□ -2.3
YKR073CP36153 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.67□□□□□ -2.3
YKR073CP36153 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.67□□□□□ -2.3
YKR073CP36153 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.67□□□□□ -2.3
YKR073CP36153 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.67□□□□□ -2.3
YKR073CP36153 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.67□□□□□ -2.3
YKR073CP36153 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.65□□□□□ -2.31
YKR073CP36153 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.65□□□□□ -2.31
YKR073CP36153 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.65□□□□□ -2.31
YKR073CP36153 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.65□□□□□ -2.31
YKR073CP36153 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.65□□□□□ -2.31
YKR073CP36153 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.65□□□□□ -2.31
YKR073CP36153 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.65□□□□□ -2.31
YKR073CP36153 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.65□□□□□ -2.31
YKR073CP36153 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.65□□□□□ -2.31
YKR073CP36153 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.65□□□□□ -2.31
YKR073CP36153 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.65□□□□□ -2.31
YKR073CP36153 SOV1YMR066W 2697 nt0.6□□□□□ -2.31
YKR073CP36153 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YKR073CP36153 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YKR073CP36153 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YKR073CP36153 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YKR073CP36153 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YKR073CP36153 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YKR073CP36153 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YKR073CP36153 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YKR073CP36153 PAU9YBL108C-A 129 nt0.58□□□□□ -2.32
YKR073CP36153 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.57□□□□□ -2.32
YKR073CP36153 IQG1YPL242C 4488 nt0.57□□□□□ -2.32
YKR073CP36153 ESP1YGR098C 4893 nt0.56□□□□□ -2.32
YKR073CP36153 UTP10YJL109C 5310 nt0.56□□□□□ -2.32
YKR073CP36153 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.53□□□□□ -2.32
YKR073CP36153 FMP27YLR454W 7887 nt0.5□□□□□ -2.33
YKR073CP36153 snR128snR128 126 nt0.49□□□□□ -2.33
YKR073CP36153 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.45□□□□□ -2.34
YKR073CP36153 YOL014WYOL014W 375 nt0.43□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 104.5 ms