Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD34P28906 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD34P28906 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD34P28906 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD34P28906 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD34P28906 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD34P28906 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CD34P28906 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CD34P28906 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD34P28906 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD34P28906 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD34P28906 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CD34P28906 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD34P28906 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD34P28906 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD34P28906 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD34P28906 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD34P28906 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD34P28906 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD34P28906 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CD34P28906 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD34P28906 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD34P28906 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD34P28906 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD34P28906 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD34P28906 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD34P28906 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD34P28906 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD34P28906 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD34P28906 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD34P28906 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD34P28906 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD34P28906 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD34P28906 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD34P28906 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD34P28906 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD34P28906 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD34P28906 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD34P28906 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD34P28906 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD34P28906 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD34P28906 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD34P28906 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD34P28906 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD34P28906 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD34P28906 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD34P28906 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD34P28906 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD34P28906 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD34P28906 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD34P28906 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD34P28906 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD34P28906 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD34P28906 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CD34P28906 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD34P28906 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD34P28906 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD34P28906 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CD34P28906 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD34P28906 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD34P28906 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD34P28906 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD34P28906 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD34P28906 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD34P28906 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD34P28906 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD34P28906 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD34P28906 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD34P28906 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD34P28906 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD34P28906 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD34P28906 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD34P28906 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD34P28906 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD34P28906 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD34P28906 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD34P28906 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD34P28906 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD34P28906 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD34P28906 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD34P28906 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD34P28906 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD34P28906 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD34P28906 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD34P28906 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD34P28906 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD34P28906 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD34P28906 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD34P28906 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD34P28906 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD34P28906 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD34P28906 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD34P28906 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD34P28906 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD34P28906 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD34P28906 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD34P28906 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD34P28906 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD34P28906 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD34P28906 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms