Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms