Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC3P19447 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms