Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
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