Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GLI3P10071 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GLI3P10071 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GLI3P10071 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GLI3P10071 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GLI3P10071 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GLI3P10071 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GLI3P10071 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GLI3P10071 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GLI3P10071 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GLI3P10071 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GLI3P10071 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GLI3P10071 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GLI3P10071 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GLI3P10071 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GLI3P10071 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GLI3P10071 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GLI3P10071 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GLI3P10071 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GLI3P10071 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GLI3P10071 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GLI3P10071 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GLI3P10071 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GLI3P10071 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GLI3P10071 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GLI3P10071 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GLI3P10071 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GLI3P10071 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GLI3P10071 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GLI3P10071 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GLI3P10071 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GLI3P10071 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GLI3P10071 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GLI3P10071 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GLI3P10071 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GLI3P10071 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GLI3P10071 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GLI3P10071 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GLI3P10071 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GLI3P10071 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GLI3P10071 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GLI3P10071 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GLI3P10071 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GLI3P10071 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GLI3P10071 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GLI3P10071 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLI3P10071 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLI3P10071 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLI3P10071 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLI3P10071 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLI3P10071 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLI3P10071 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLI3P10071 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLI3P10071 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GLI3P10071 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLI3P10071 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLI3P10071 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLI3P10071 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLI3P10071 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLI3P10071 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLI3P10071 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLI3P10071 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLI3P10071 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLI3P10071 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLI3P10071 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLI3P10071 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLI3P10071 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLI3P10071 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLI3P10071 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLI3P10071 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLI3P10071 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLI3P10071 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLI3P10071 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLI3P10071 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLI3P10071 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLI3P10071 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLI3P10071 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLI3P10071 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GLI3P10071 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLI3P10071 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GLI3P10071 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GLI3P10071 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GLI3P10071 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GLI3P10071 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GLI3P10071 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GLI3P10071 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GLI3P10071 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GLI3P10071 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GLI3P10071 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GLI3P10071 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GLI3P10071 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GLI3P10071 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GLI3P10071 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GLI3P10071 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GLI3P10071 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GLI3P10071 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GLI3P10071 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GLI3P10071 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GLI3P10071 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GLI3P10071 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms