Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
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