Protein–RNA interactions for Protein: O95248

SBF1, Myotubularin-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBF1O95248 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBF1O95248 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBF1O95248 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBF1O95248 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SBF1O95248 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBF1O95248 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBF1O95248 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBF1O95248 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBF1O95248 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBF1O95248 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBF1O95248 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBF1O95248 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SBF1O95248 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SBF1O95248 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBF1O95248 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBF1O95248 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBF1O95248 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBF1O95248 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBF1O95248 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBF1O95248 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBF1O95248 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBF1O95248 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBF1O95248 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBF1O95248 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SBF1O95248 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBF1O95248 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBF1O95248 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBF1O95248 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBF1O95248 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBF1O95248 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBF1O95248 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBF1O95248 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBF1O95248 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SBF1O95248 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBF1O95248 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBF1O95248 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBF1O95248 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBF1O95248 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBF1O95248 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBF1O95248 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBF1O95248 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBF1O95248 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBF1O95248 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBF1O95248 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBF1O95248 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBF1O95248 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBF1O95248 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBF1O95248 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SBF1O95248 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SBF1O95248 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SBF1O95248 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBF1O95248 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBF1O95248 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBF1O95248 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBF1O95248 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBF1O95248 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBF1O95248 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBF1O95248 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBF1O95248 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBF1O95248 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBF1O95248 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBF1O95248 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBF1O95248 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBF1O95248 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBF1O95248 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBF1O95248 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SBF1O95248 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SBF1O95248 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBF1O95248 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SBF1O95248 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBF1O95248 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBF1O95248 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SBF1O95248 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SBF1O95248 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SBF1O95248 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SBF1O95248 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SBF1O95248 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SBF1O95248 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SBF1O95248 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SBF1O95248 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SBF1O95248 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SBF1O95248 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SBF1O95248 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SBF1O95248 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SBF1O95248 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SBF1O95248 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SBF1O95248 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SBF1O95248 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SBF1O95248 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SBF1O95248 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SBF1O95248 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SBF1O95248 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SBF1O95248 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SBF1O95248 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SBF1O95248 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SBF1O95248 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SBF1O95248 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SBF1O95248 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SBF1O95248 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SBF1O95248 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms