Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
N4BP1O75113 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
N4BP1O75113 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
N4BP1O75113 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
N4BP1O75113 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
N4BP1O75113 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms