Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms