Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms