Protein–RNA interactions for Protein: O15453

NBR2, Next to BRCA1 gene 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR2O15453 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NBR2O15453 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NBR2O15453 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NBR2O15453 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NBR2O15453 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NBR2O15453 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NBR2O15453 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NBR2O15453 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NBR2O15453 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NBR2O15453 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NBR2O15453 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NBR2O15453 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NBR2O15453 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NBR2O15453 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NBR2O15453 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NBR2O15453 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NBR2O15453 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NBR2O15453 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NBR2O15453 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NBR2O15453 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NBR2O15453 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NBR2O15453 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NBR2O15453 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NBR2O15453 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NBR2O15453 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NBR2O15453 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NBR2O15453 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NBR2O15453 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NBR2O15453 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NBR2O15453 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NBR2O15453 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NBR2O15453 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NBR2O15453 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NBR2O15453 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NBR2O15453 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NBR2O15453 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NBR2O15453 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NBR2O15453 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NBR2O15453 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NBR2O15453 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NBR2O15453 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NBR2O15453 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NBR2O15453 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NBR2O15453 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NBR2O15453 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NBR2O15453 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NBR2O15453 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NBR2O15453 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NBR2O15453 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NBR2O15453 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NBR2O15453 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBR2O15453 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBR2O15453 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBR2O15453 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBR2O15453 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBR2O15453 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBR2O15453 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBR2O15453 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBR2O15453 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBR2O15453 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBR2O15453 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBR2O15453 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBR2O15453 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBR2O15453 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBR2O15453 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBR2O15453 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBR2O15453 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBR2O15453 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBR2O15453 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBR2O15453 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBR2O15453 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBR2O15453 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBR2O15453 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBR2O15453 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBR2O15453 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBR2O15453 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBR2O15453 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBR2O15453 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBR2O15453 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBR2O15453 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NBR2O15453 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBR2O15453 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBR2O15453 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBR2O15453 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBR2O15453 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBR2O15453 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBR2O15453 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBR2O15453 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBR2O15453 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBR2O15453 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBR2O15453 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBR2O15453 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NBR2O15453 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBR2O15453 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBR2O15453 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBR2O15453 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBR2O15453 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBR2O15453 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBR2O15453 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBR2O15453 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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