Protein–RNA interactions for Protein: O14787

TNPO2, Transportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 897 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO2O14787 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNPO2O14787 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO2O14787 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO2O14787 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO2O14787 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO2O14787 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO2O14787 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO2O14787 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO2O14787 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO2O14787 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO2O14787 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO2O14787 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO2O14787 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO2O14787 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO2O14787 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO2O14787 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO2O14787 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO2O14787 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO2O14787 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO2O14787 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO2O14787 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO2O14787 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO2O14787 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO2O14787 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO2O14787 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO2O14787 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO2O14787 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO2O14787 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO2O14787 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO2O14787 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms