Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms