Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L12C9JPN9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP17L12C9JPN9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP17L12C9JPN9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP17L12C9JPN9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP17L12C9JPN9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L12C9JPN9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
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