Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TTLL13PA6NNM8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TTLL13PA6NNM8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TTLL13PA6NNM8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TTLL13PA6NNM8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL13PA6NNM8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL13PA6NNM8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL13PA6NNM8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL13PA6NNM8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL13PA6NNM8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL13PA6NNM8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL13PA6NNM8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL13PA6NNM8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL13PA6NNM8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL13PA6NNM8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL13PA6NNM8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL13PA6NNM8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL13PA6NNM8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL13PA6NNM8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL13PA6NNM8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL13PA6NNM8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL13PA6NNM8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL13PA6NNM8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL13PA6NNM8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL13PA6NNM8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLL13PA6NNM8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLL13PA6NNM8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLL13PA6NNM8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLL13PA6NNM8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLL13PA6NNM8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms