Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms