Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms