Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms