Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z275

Rlbp1, Retinaldehyde-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rlbp1Q9Z275 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rlbp1Q9Z275 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rlbp1Q9Z275 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Rlbp1Q9Z275 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Rlbp1Q9Z275 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rlbp1Q9Z275 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rlbp1Q9Z275 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rlbp1Q9Z275 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rlbp1Q9Z275 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rlbp1Q9Z275 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rlbp1Q9Z275 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Rlbp1Q9Z275 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rlbp1Q9Z275 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rlbp1Q9Z275 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rlbp1Q9Z275 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rlbp1Q9Z275 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rlbp1Q9Z275 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rlbp1Q9Z275 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rlbp1Q9Z275 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Rlbp1Q9Z275 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rlbp1Q9Z275 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rlbp1Q9Z275 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rlbp1Q9Z275 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rlbp1Q9Z275 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rlbp1Q9Z275 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Rlbp1Q9Z275 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rlbp1Q9Z275 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rlbp1Q9Z275 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rlbp1Q9Z275 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rlbp1Q9Z275 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rlbp1Q9Z275 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rlbp1Q9Z275 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rlbp1Q9Z275 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rlbp1Q9Z275 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rlbp1Q9Z275 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rlbp1Q9Z275 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rlbp1Q9Z275 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rlbp1Q9Z275 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rlbp1Q9Z275 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rlbp1Q9Z275 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rlbp1Q9Z275 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rlbp1Q9Z275 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rlbp1Q9Z275 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Rlbp1Q9Z275 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rlbp1Q9Z275 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rlbp1Q9Z275 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rlbp1Q9Z275 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rlbp1Q9Z275 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rlbp1Q9Z275 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rlbp1Q9Z275 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rlbp1Q9Z275 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rlbp1Q9Z275 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rlbp1Q9Z275 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rlbp1Q9Z275 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rlbp1Q9Z275 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rlbp1Q9Z275 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rlbp1Q9Z275 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rlbp1Q9Z275 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rlbp1Q9Z275 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rlbp1Q9Z275 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rlbp1Q9Z275 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rlbp1Q9Z275 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rlbp1Q9Z275 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rlbp1Q9Z275 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rlbp1Q9Z275 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rlbp1Q9Z275 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Rlbp1Q9Z275 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rlbp1Q9Z275 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rlbp1Q9Z275 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rlbp1Q9Z275 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rlbp1Q9Z275 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rlbp1Q9Z275 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rlbp1Q9Z275 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rlbp1Q9Z275 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rlbp1Q9Z275 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rlbp1Q9Z275 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rlbp1Q9Z275 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rlbp1Q9Z275 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rlbp1Q9Z275 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Rlbp1Q9Z275 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rlbp1Q9Z275 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rlbp1Q9Z275 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rlbp1Q9Z275 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rlbp1Q9Z275 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rlbp1Q9Z275 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rlbp1Q9Z275 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rlbp1Q9Z275 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rlbp1Q9Z275 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rlbp1Q9Z275 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rlbp1Q9Z275 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rlbp1Q9Z275 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rlbp1Q9Z275 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rlbp1Q9Z275 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rlbp1Q9Z275 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rlbp1Q9Z275 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rlbp1Q9Z275 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rlbp1Q9Z275 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rlbp1Q9Z275 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rlbp1Q9Z275 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rlbp1Q9Z275 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms