Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z266

Snapin, SNARE-associated protein Snapin, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnapinQ9Z266 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SnapinQ9Z266 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SnapinQ9Z266 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SnapinQ9Z266 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SnapinQ9Z266 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SnapinQ9Z266 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SnapinQ9Z266 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SnapinQ9Z266 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SnapinQ9Z266 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SnapinQ9Z266 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SnapinQ9Z266 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SnapinQ9Z266 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SnapinQ9Z266 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SnapinQ9Z266 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SnapinQ9Z266 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SnapinQ9Z266 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SnapinQ9Z266 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SnapinQ9Z266 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SnapinQ9Z266 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SnapinQ9Z266 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SnapinQ9Z266 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SnapinQ9Z266 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SnapinQ9Z266 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SnapinQ9Z266 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SnapinQ9Z266 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SnapinQ9Z266 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SnapinQ9Z266 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SnapinQ9Z266 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SnapinQ9Z266 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SnapinQ9Z266 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SnapinQ9Z266 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SnapinQ9Z266 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SnapinQ9Z266 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SnapinQ9Z266 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SnapinQ9Z266 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SnapinQ9Z266 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SnapinQ9Z266 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SnapinQ9Z266 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SnapinQ9Z266 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SnapinQ9Z266 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SnapinQ9Z266 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SnapinQ9Z266 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SnapinQ9Z266 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SnapinQ9Z266 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SnapinQ9Z266 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SnapinQ9Z266 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SnapinQ9Z266 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SnapinQ9Z266 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SnapinQ9Z266 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SnapinQ9Z266 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SnapinQ9Z266 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SnapinQ9Z266 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SnapinQ9Z266 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SnapinQ9Z266 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SnapinQ9Z266 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SnapinQ9Z266 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SnapinQ9Z266 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SnapinQ9Z266 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SnapinQ9Z266 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SnapinQ9Z266 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SnapinQ9Z266 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SnapinQ9Z266 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SnapinQ9Z266 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SnapinQ9Z266 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SnapinQ9Z266 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SnapinQ9Z266 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SnapinQ9Z266 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SnapinQ9Z266 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SnapinQ9Z266 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SnapinQ9Z266 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SnapinQ9Z266 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SnapinQ9Z266 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SnapinQ9Z266 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SnapinQ9Z266 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SnapinQ9Z266 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SnapinQ9Z266 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SnapinQ9Z266 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SnapinQ9Z266 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SnapinQ9Z266 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SnapinQ9Z266 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SnapinQ9Z266 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SnapinQ9Z266 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SnapinQ9Z266 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SnapinQ9Z266 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SnapinQ9Z266 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SnapinQ9Z266 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SnapinQ9Z266 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SnapinQ9Z266 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SnapinQ9Z266 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SnapinQ9Z266 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SnapinQ9Z266 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SnapinQ9Z266 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SnapinQ9Z266 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SnapinQ9Z266 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SnapinQ9Z266 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SnapinQ9Z266 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SnapinQ9Z266 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SnapinQ9Z266 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SnapinQ9Z266 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SnapinQ9Z266 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms