Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z183

Padi4, Protein-arginine deiminase type-4, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi4Q9Z183 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Padi4Q9Z183 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Padi4Q9Z183 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Padi4Q9Z183 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Padi4Q9Z183 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Padi4Q9Z183 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Padi4Q9Z183 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Padi4Q9Z183 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Padi4Q9Z183 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Padi4Q9Z183 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Padi4Q9Z183 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Padi4Q9Z183 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Padi4Q9Z183 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Padi4Q9Z183 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Padi4Q9Z183 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Padi4Q9Z183 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Padi4Q9Z183 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Padi4Q9Z183 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Padi4Q9Z183 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Padi4Q9Z183 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Padi4Q9Z183 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Padi4Q9Z183 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Padi4Q9Z183 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Padi4Q9Z183 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Padi4Q9Z183 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Padi4Q9Z183 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Padi4Q9Z183 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Padi4Q9Z183 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Padi4Q9Z183 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Padi4Q9Z183 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Padi4Q9Z183 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Padi4Q9Z183 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Padi4Q9Z183 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Padi4Q9Z183 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Padi4Q9Z183 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Padi4Q9Z183 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Padi4Q9Z183 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Padi4Q9Z183 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Padi4Q9Z183 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Padi4Q9Z183 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Padi4Q9Z183 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Padi4Q9Z183 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Padi4Q9Z183 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Padi4Q9Z183 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Padi4Q9Z183 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Padi4Q9Z183 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Padi4Q9Z183 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Padi4Q9Z183 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Padi4Q9Z183 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Padi4Q9Z183 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Padi4Q9Z183 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Padi4Q9Z183 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Padi4Q9Z183 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Padi4Q9Z183 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Padi4Q9Z183 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Padi4Q9Z183 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Padi4Q9Z183 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Padi4Q9Z183 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Padi4Q9Z183 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Padi4Q9Z183 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Padi4Q9Z183 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Padi4Q9Z183 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Padi4Q9Z183 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Padi4Q9Z183 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Padi4Q9Z183 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Padi4Q9Z183 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Padi4Q9Z183 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Padi4Q9Z183 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Padi4Q9Z183 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Padi4Q9Z183 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Padi4Q9Z183 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Padi4Q9Z183 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Padi4Q9Z183 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Padi4Q9Z183 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Padi4Q9Z183 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Padi4Q9Z183 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Padi4Q9Z183 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Padi4Q9Z183 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Padi4Q9Z183 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Padi4Q9Z183 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Padi4Q9Z183 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Padi4Q9Z183 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Padi4Q9Z183 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Padi4Q9Z183 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Padi4Q9Z183 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Padi4Q9Z183 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Padi4Q9Z183 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Padi4Q9Z183 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Padi4Q9Z183 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Padi4Q9Z183 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Padi4Q9Z183 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Padi4Q9Z183 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Padi4Q9Z183 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Padi4Q9Z183 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Padi4Q9Z183 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Padi4Q9Z183 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Padi4Q9Z183 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Padi4Q9Z183 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Padi4Q9Z183 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Padi4Q9Z183 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms