Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0J7

Gdf15, Growth/differentiation factor 15, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf15Q9Z0J7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gdf15Q9Z0J7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gdf15Q9Z0J7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gdf15Q9Z0J7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gdf15Q9Z0J7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gdf15Q9Z0J7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gdf15Q9Z0J7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gdf15Q9Z0J7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gdf15Q9Z0J7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gdf15Q9Z0J7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gdf15Q9Z0J7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gdf15Q9Z0J7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gdf15Q9Z0J7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gdf15Q9Z0J7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gdf15Q9Z0J7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gdf15Q9Z0J7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gdf15Q9Z0J7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gdf15Q9Z0J7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gdf15Q9Z0J7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gdf15Q9Z0J7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gdf15Q9Z0J7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gdf15Q9Z0J7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gdf15Q9Z0J7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gdf15Q9Z0J7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gdf15Q9Z0J7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gdf15Q9Z0J7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gdf15Q9Z0J7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gdf15Q9Z0J7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdf15Q9Z0J7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdf15Q9Z0J7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdf15Q9Z0J7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdf15Q9Z0J7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdf15Q9Z0J7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdf15Q9Z0J7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gdf15Q9Z0J7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gdf15Q9Z0J7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gdf15Q9Z0J7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gdf15Q9Z0J7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gdf15Q9Z0J7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gdf15Q9Z0J7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdf15Q9Z0J7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdf15Q9Z0J7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdf15Q9Z0J7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdf15Q9Z0J7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gdf15Q9Z0J7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gdf15Q9Z0J7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gdf15Q9Z0J7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gdf15Q9Z0J7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gdf15Q9Z0J7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gdf15Q9Z0J7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gdf15Q9Z0J7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gdf15Q9Z0J7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gdf15Q9Z0J7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gdf15Q9Z0J7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gdf15Q9Z0J7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gdf15Q9Z0J7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gdf15Q9Z0J7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gdf15Q9Z0J7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gdf15Q9Z0J7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gdf15Q9Z0J7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gdf15Q9Z0J7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gdf15Q9Z0J7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
Gdf15Q9Z0J7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gdf15Q9Z0J7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gdf15Q9Z0J7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gdf15Q9Z0J7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gdf15Q9Z0J7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gdf15Q9Z0J7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gdf15Q9Z0J7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gdf15Q9Z0J7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gdf15Q9Z0J7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gdf15Q9Z0J7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gdf15Q9Z0J7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gdf15Q9Z0J7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gdf15Q9Z0J7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gdf15Q9Z0J7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gdf15Q9Z0J7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gdf15Q9Z0J7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gdf15Q9Z0J7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gdf15Q9Z0J7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gdf15Q9Z0J7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gdf15Q9Z0J7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gdf15Q9Z0J7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gdf15Q9Z0J7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gdf15Q9Z0J7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gdf15Q9Z0J7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gdf15Q9Z0J7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gdf15Q9Z0J7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gdf15Q9Z0J7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gdf15Q9Z0J7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gdf15Q9Z0J7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gdf15Q9Z0J7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gdf15Q9Z0J7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gdf15Q9Z0J7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gdf15Q9Z0J7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gdf15Q9Z0J7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gdf15Q9Z0J7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gdf15Q9Z0J7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gdf15Q9Z0J7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gdf15Q9Z0J7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms