Protein–RNA interactions for Protein: Q9R207

Nbn, Nibrin, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbnQ9R207 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NbnQ9R207 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NbnQ9R207 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NbnQ9R207 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NbnQ9R207 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NbnQ9R207 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NbnQ9R207 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NbnQ9R207 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NbnQ9R207 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NbnQ9R207 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NbnQ9R207 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NbnQ9R207 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NbnQ9R207 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NbnQ9R207 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NbnQ9R207 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NbnQ9R207 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NbnQ9R207 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NbnQ9R207 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NbnQ9R207 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NbnQ9R207 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NbnQ9R207 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NbnQ9R207 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NbnQ9R207 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NbnQ9R207 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NbnQ9R207 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NbnQ9R207 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NbnQ9R207 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NbnQ9R207 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NbnQ9R207 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NbnQ9R207 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NbnQ9R207 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NbnQ9R207 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NbnQ9R207 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NbnQ9R207 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NbnQ9R207 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NbnQ9R207 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NbnQ9R207 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NbnQ9R207 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NbnQ9R207 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NbnQ9R207 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NbnQ9R207 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NbnQ9R207 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NbnQ9R207 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NbnQ9R207 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NbnQ9R207 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NbnQ9R207 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NbnQ9R207 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NbnQ9R207 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NbnQ9R207 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NbnQ9R207 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NbnQ9R207 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NbnQ9R207 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NbnQ9R207 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NbnQ9R207 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NbnQ9R207 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NbnQ9R207 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NbnQ9R207 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NbnQ9R207 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NbnQ9R207 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NbnQ9R207 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NbnQ9R207 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NbnQ9R207 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NbnQ9R207 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NbnQ9R207 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NbnQ9R207 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NbnQ9R207 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NbnQ9R207 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NbnQ9R207 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NbnQ9R207 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NbnQ9R207 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NbnQ9R207 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NbnQ9R207 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NbnQ9R207 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NbnQ9R207 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NbnQ9R207 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NbnQ9R207 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NbnQ9R207 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NbnQ9R207 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NbnQ9R207 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NbnQ9R207 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NbnQ9R207 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NbnQ9R207 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NbnQ9R207 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NbnQ9R207 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NbnQ9R207 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NbnQ9R207 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NbnQ9R207 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NbnQ9R207 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NbnQ9R207 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NbnQ9R207 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NbnQ9R207 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NbnQ9R207 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NbnQ9R207 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NbnQ9R207 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NbnQ9R207 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NbnQ9R207 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NbnQ9R207 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NbnQ9R207 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NbnQ9R207 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NbnQ9R207 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.8 ms