Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sorbs3Q9R1Z8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sorbs3Q9R1Z8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sorbs3Q9R1Z8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sorbs3Q9R1Z8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sorbs3Q9R1Z8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sorbs3Q9R1Z8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sorbs3Q9R1Z8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sorbs3Q9R1Z8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sorbs3Q9R1Z8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sorbs3Q9R1Z8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sorbs3Q9R1Z8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sorbs3Q9R1Z8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sorbs3Q9R1Z8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sorbs3Q9R1Z8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sorbs3Q9R1Z8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sorbs3Q9R1Z8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sorbs3Q9R1Z8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sorbs3Q9R1Z8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sorbs3Q9R1Z8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sorbs3Q9R1Z8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sorbs3Q9R1Z8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sorbs3Q9R1Z8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sorbs3Q9R1Z8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sorbs3Q9R1Z8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sorbs3Q9R1Z8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sorbs3Q9R1Z8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sorbs3Q9R1Z8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sorbs3Q9R1Z8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sorbs3Q9R1Z8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sorbs3Q9R1Z8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sorbs3Q9R1Z8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sorbs3Q9R1Z8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sorbs3Q9R1Z8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sorbs3Q9R1Z8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sorbs3Q9R1Z8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sorbs3Q9R1Z8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sorbs3Q9R1Z8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Sorbs3Q9R1Z8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sorbs3Q9R1Z8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sorbs3Q9R1Z8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sorbs3Q9R1Z8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sorbs3Q9R1Z8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sorbs3Q9R1Z8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sorbs3Q9R1Z8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sorbs3Q9R1Z8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sorbs3Q9R1Z8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sorbs3Q9R1Z8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sorbs3Q9R1Z8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sorbs3Q9R1Z8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sorbs3Q9R1Z8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sorbs3Q9R1Z8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sorbs3Q9R1Z8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sorbs3Q9R1Z8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sorbs3Q9R1Z8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sorbs3Q9R1Z8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sorbs3Q9R1Z8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sorbs3Q9R1Z8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Sorbs3Q9R1Z8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Sorbs3Q9R1Z8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sorbs3Q9R1Z8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26■■□□□ 1.75
Sorbs3Q9R1Z8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sorbs3Q9R1Z8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sorbs3Q9R1Z8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sorbs3Q9R1Z8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sorbs3Q9R1Z8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sorbs3Q9R1Z8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sorbs3Q9R1Z8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sorbs3Q9R1Z8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sorbs3Q9R1Z8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sorbs3Q9R1Z8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sorbs3Q9R1Z8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sorbs3Q9R1Z8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sorbs3Q9R1Z8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sorbs3Q9R1Z8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sorbs3Q9R1Z8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sorbs3Q9R1Z8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sorbs3Q9R1Z8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sorbs3Q9R1Z8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sorbs3Q9R1Z8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Sorbs3Q9R1Z8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sorbs3Q9R1Z8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sorbs3Q9R1Z8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sorbs3Q9R1Z8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sorbs3Q9R1Z8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Sorbs3Q9R1Z8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sorbs3Q9R1Z8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sorbs3Q9R1Z8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sorbs3Q9R1Z8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sorbs3Q9R1Z8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sorbs3Q9R1Z8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sorbs3Q9R1Z8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sorbs3Q9R1Z8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sorbs3Q9R1Z8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sorbs3Q9R1Z8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sorbs3Q9R1Z8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms