Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnfrsf10bQ9QZM4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnfrsf10bQ9QZM4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnfrsf10bQ9QZM4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnfrsf10bQ9QZM4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnfrsf10bQ9QZM4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnfrsf10bQ9QZM4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnfrsf10bQ9QZM4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnfrsf10bQ9QZM4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnfrsf10bQ9QZM4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnfrsf10bQ9QZM4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnfrsf10bQ9QZM4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnfrsf10bQ9QZM4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnfrsf10bQ9QZM4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnfrsf10bQ9QZM4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnfrsf10bQ9QZM4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms