Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Copg1Q9QZE5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Copg1Q9QZE5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Copg1Q9QZE5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Copg1Q9QZE5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Copg1Q9QZE5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Copg1Q9QZE5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Copg1Q9QZE5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Copg1Q9QZE5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Copg1Q9QZE5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Copg1Q9QZE5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Copg1Q9QZE5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Copg1Q9QZE5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Copg1Q9QZE5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Copg1Q9QZE5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Copg1Q9QZE5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Copg1Q9QZE5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Copg1Q9QZE5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Copg1Q9QZE5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Copg1Q9QZE5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Copg1Q9QZE5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Copg1Q9QZE5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Copg1Q9QZE5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Copg1Q9QZE5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Copg1Q9QZE5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Copg1Q9QZE5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Copg1Q9QZE5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Copg1Q9QZE5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Copg1Q9QZE5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Copg1Q9QZE5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Copg1Q9QZE5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Copg1Q9QZE5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Copg1Q9QZE5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Copg1Q9QZE5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Copg1Q9QZE5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Copg1Q9QZE5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Copg1Q9QZE5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Copg1Q9QZE5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Copg1Q9QZE5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Copg1Q9QZE5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Copg1Q9QZE5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Copg1Q9QZE5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Copg1Q9QZE5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Copg1Q9QZE5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Copg1Q9QZE5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Copg1Q9QZE5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Copg1Q9QZE5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Copg1Q9QZE5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Copg1Q9QZE5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Copg1Q9QZE5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Copg1Q9QZE5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Copg1Q9QZE5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Copg1Q9QZE5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Copg1Q9QZE5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Copg1Q9QZE5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Copg1Q9QZE5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Copg1Q9QZE5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Copg1Q9QZE5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Copg1Q9QZE5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Copg1Q9QZE5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Copg1Q9QZE5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Copg1Q9QZE5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Copg1Q9QZE5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Copg1Q9QZE5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Copg1Q9QZE5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Copg1Q9QZE5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Copg1Q9QZE5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Copg1Q9QZE5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Copg1Q9QZE5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Copg1Q9QZE5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Copg1Q9QZE5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Copg1Q9QZE5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Copg1Q9QZE5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Copg1Q9QZE5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Copg1Q9QZE5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Copg1Q9QZE5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Copg1Q9QZE5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Copg1Q9QZE5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Copg1Q9QZE5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Copg1Q9QZE5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Copg1Q9QZE5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Copg1Q9QZE5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Copg1Q9QZE5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Copg1Q9QZE5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Copg1Q9QZE5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Copg1Q9QZE5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Copg1Q9QZE5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Copg1Q9QZE5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Copg1Q9QZE5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Copg1Q9QZE5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Copg1Q9QZE5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Copg1Q9QZE5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Copg1Q9QZE5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Copg1Q9QZE5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Copg1Q9QZE5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Copg1Q9QZE5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Copg1Q9QZE5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Copg1Q9QZE5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Copg1Q9QZE5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Copg1Q9QZE5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms