Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdzd4Q9QY39 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdzd4Q9QY39 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdzd4Q9QY39 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdzd4Q9QY39 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdzd4Q9QY39 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdzd4Q9QY39 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdzd4Q9QY39 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdzd4Q9QY39 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdzd4Q9QY39 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdzd4Q9QY39 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdzd4Q9QY39 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdzd4Q9QY39 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pdzd4Q9QY39 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pdzd4Q9QY39 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pdzd4Q9QY39 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pdzd4Q9QY39 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdzd4Q9QY39 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdzd4Q9QY39 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdzd4Q9QY39 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdzd4Q9QY39 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdzd4Q9QY39 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdzd4Q9QY39 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdzd4Q9QY39 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdzd4Q9QY39 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdzd4Q9QY39 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdzd4Q9QY39 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pdzd4Q9QY39 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pdzd4Q9QY39 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pdzd4Q9QY39 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdzd4Q9QY39 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdzd4Q9QY39 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdzd4Q9QY39 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdzd4Q9QY39 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdzd4Q9QY39 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdzd4Q9QY39 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdzd4Q9QY39 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdzd4Q9QY39 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdzd4Q9QY39 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdzd4Q9QY39 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdzd4Q9QY39 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdzd4Q9QY39 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdzd4Q9QY39 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdzd4Q9QY39 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdzd4Q9QY39 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdzd4Q9QY39 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdzd4Q9QY39 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdzd4Q9QY39 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdzd4Q9QY39 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdzd4Q9QY39 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdzd4Q9QY39 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdzd4Q9QY39 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdzd4Q9QY39 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdzd4Q9QY39 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdzd4Q9QY39 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdzd4Q9QY39 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdzd4Q9QY39 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdzd4Q9QY39 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdzd4Q9QY39 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdzd4Q9QY39 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdzd4Q9QY39 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdzd4Q9QY39 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdzd4Q9QY39 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdzd4Q9QY39 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdzd4Q9QY39 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdzd4Q9QY39 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdzd4Q9QY39 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdzd4Q9QY39 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdzd4Q9QY39 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdzd4Q9QY39 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdzd4Q9QY39 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdzd4Q9QY39 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdzd4Q9QY39 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdzd4Q9QY39 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdzd4Q9QY39 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdzd4Q9QY39 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdzd4Q9QY39 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdzd4Q9QY39 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdzd4Q9QY39 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdzd4Q9QY39 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdzd4Q9QY39 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdzd4Q9QY39 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdzd4Q9QY39 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdzd4Q9QY39 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdzd4Q9QY39 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdzd4Q9QY39 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdzd4Q9QY39 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdzd4Q9QY39 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdzd4Q9QY39 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdzd4Q9QY39 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdzd4Q9QY39 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdzd4Q9QY39 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdzd4Q9QY39 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdzd4Q9QY39 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdzd4Q9QY39 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdzd4Q9QY39 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdzd4Q9QY39 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdzd4Q9QY39 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdzd4Q9QY39 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdzd4Q9QY39 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms