Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkp3Q9QY23 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkp3Q9QY23 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkp3Q9QY23 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkp3Q9QY23 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkp3Q9QY23 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkp3Q9QY23 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkp3Q9QY23 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkp3Q9QY23 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkp3Q9QY23 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkp3Q9QY23 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkp3Q9QY23 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkp3Q9QY23 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkp3Q9QY23 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkp3Q9QY23 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pkp3Q9QY23 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkp3Q9QY23 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkp3Q9QY23 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkp3Q9QY23 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkp3Q9QY23 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkp3Q9QY23 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkp3Q9QY23 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkp3Q9QY23 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkp3Q9QY23 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkp3Q9QY23 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkp3Q9QY23 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkp3Q9QY23 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkp3Q9QY23 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkp3Q9QY23 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkp3Q9QY23 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkp3Q9QY23 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkp3Q9QY23 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkp3Q9QY23 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkp3Q9QY23 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkp3Q9QY23 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkp3Q9QY23 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkp3Q9QY23 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkp3Q9QY23 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkp3Q9QY23 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkp3Q9QY23 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkp3Q9QY23 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkp3Q9QY23 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkp3Q9QY23 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Pkp3Q9QY23 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkp3Q9QY23 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkp3Q9QY23 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkp3Q9QY23 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkp3Q9QY23 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkp3Q9QY23 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkp3Q9QY23 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkp3Q9QY23 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkp3Q9QY23 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkp3Q9QY23 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkp3Q9QY23 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkp3Q9QY23 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkp3Q9QY23 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkp3Q9QY23 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkp3Q9QY23 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkp3Q9QY23 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkp3Q9QY23 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkp3Q9QY23 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkp3Q9QY23 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkp3Q9QY23 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkp3Q9QY23 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkp3Q9QY23 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkp3Q9QY23 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkp3Q9QY23 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkp3Q9QY23 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkp3Q9QY23 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkp3Q9QY23 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkp3Q9QY23 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkp3Q9QY23 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkp3Q9QY23 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkp3Q9QY23 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkp3Q9QY23 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkp3Q9QY23 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkp3Q9QY23 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkp3Q9QY23 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkp3Q9QY23 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkp3Q9QY23 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkp3Q9QY23 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkp3Q9QY23 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pkp3Q9QY23 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pkp3Q9QY23 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pkp3Q9QY23 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pkp3Q9QY23 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkp3Q9QY23 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkp3Q9QY23 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkp3Q9QY23 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkp3Q9QY23 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkp3Q9QY23 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkp3Q9QY23 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkp3Q9QY23 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkp3Q9QY23 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkp3Q9QY23 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkp3Q9QY23 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkp3Q9QY23 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkp3Q9QY23 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkp3Q9QY23 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkp3Q9QY23 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 298.7 ms