Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM0

Itga2b, Integrin alpha-IIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga2bQ9QUM0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Itga2bQ9QUM0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Itga2bQ9QUM0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Itga2bQ9QUM0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Itga2bQ9QUM0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Itga2bQ9QUM0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Itga2bQ9QUM0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Itga2bQ9QUM0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Itga2bQ9QUM0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Itga2bQ9QUM0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Itga2bQ9QUM0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Itga2bQ9QUM0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Itga2bQ9QUM0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Itga2bQ9QUM0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Itga2bQ9QUM0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Itga2bQ9QUM0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Itga2bQ9QUM0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Itga2bQ9QUM0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Itga2bQ9QUM0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Itga2bQ9QUM0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Itga2bQ9QUM0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Itga2bQ9QUM0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Itga2bQ9QUM0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Itga2bQ9QUM0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Itga2bQ9QUM0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Itga2bQ9QUM0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Itga2bQ9QUM0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Itga2bQ9QUM0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Itga2bQ9QUM0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Itga2bQ9QUM0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Itga2bQ9QUM0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Itga2bQ9QUM0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Itga2bQ9QUM0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Itga2bQ9QUM0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Itga2bQ9QUM0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Itga2bQ9QUM0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Itga2bQ9QUM0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Itga2bQ9QUM0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Itga2bQ9QUM0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Itga2bQ9QUM0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Itga2bQ9QUM0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Itga2bQ9QUM0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Itga2bQ9QUM0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Itga2bQ9QUM0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Itga2bQ9QUM0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Itga2bQ9QUM0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Itga2bQ9QUM0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Itga2bQ9QUM0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Itga2bQ9QUM0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Itga2bQ9QUM0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Itga2bQ9QUM0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Itga2bQ9QUM0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Itga2bQ9QUM0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Itga2bQ9QUM0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Itga2bQ9QUM0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itga2bQ9QUM0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itga2bQ9QUM0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itga2bQ9QUM0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itga2bQ9QUM0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Itga2bQ9QUM0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Itga2bQ9QUM0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Itga2bQ9QUM0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Itga2bQ9QUM0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Itga2bQ9QUM0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Itga2bQ9QUM0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Itga2bQ9QUM0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Itga2bQ9QUM0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Itga2bQ9QUM0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Itga2bQ9QUM0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Itga2bQ9QUM0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Itga2bQ9QUM0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Itga2bQ9QUM0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Itga2bQ9QUM0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Itga2bQ9QUM0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Itga2bQ9QUM0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Itga2bQ9QUM0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Itga2bQ9QUM0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Itga2bQ9QUM0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Itga2bQ9QUM0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Itga2bQ9QUM0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Itga2bQ9QUM0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Itga2bQ9QUM0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Itga2bQ9QUM0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Itga2bQ9QUM0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Itga2bQ9QUM0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Itga2bQ9QUM0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Itga2bQ9QUM0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Itga2bQ9QUM0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Itga2bQ9QUM0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Itga2bQ9QUM0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Itga2bQ9QUM0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Itga2bQ9QUM0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Itga2bQ9QUM0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Itga2bQ9QUM0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Itga2bQ9QUM0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Itga2bQ9QUM0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Itga2bQ9QUM0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Itga2bQ9QUM0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Itga2bQ9QUM0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Itga2bQ9QUM0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms