Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cln8Q9QUK3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cln8Q9QUK3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cln8Q9QUK3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cln8Q9QUK3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cln8Q9QUK3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cln8Q9QUK3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cln8Q9QUK3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cln8Q9QUK3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cln8Q9QUK3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cln8Q9QUK3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cln8Q9QUK3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cln8Q9QUK3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cln8Q9QUK3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cln8Q9QUK3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cln8Q9QUK3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cln8Q9QUK3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cln8Q9QUK3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cln8Q9QUK3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cln8Q9QUK3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cln8Q9QUK3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cln8Q9QUK3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cln8Q9QUK3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cln8Q9QUK3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cln8Q9QUK3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cln8Q9QUK3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cln8Q9QUK3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cln8Q9QUK3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cln8Q9QUK3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cln8Q9QUK3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cln8Q9QUK3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cln8Q9QUK3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cln8Q9QUK3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cln8Q9QUK3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cln8Q9QUK3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cln8Q9QUK3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cln8Q9QUK3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cln8Q9QUK3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cln8Q9QUK3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cln8Q9QUK3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cln8Q9QUK3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cln8Q9QUK3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cln8Q9QUK3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cln8Q9QUK3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cln8Q9QUK3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cln8Q9QUK3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cln8Q9QUK3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cln8Q9QUK3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cln8Q9QUK3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cln8Q9QUK3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cln8Q9QUK3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cln8Q9QUK3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cln8Q9QUK3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cln8Q9QUK3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cln8Q9QUK3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cln8Q9QUK3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cln8Q9QUK3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cln8Q9QUK3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cln8Q9QUK3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cln8Q9QUK3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cln8Q9QUK3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cln8Q9QUK3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cln8Q9QUK3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cln8Q9QUK3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cln8Q9QUK3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cln8Q9QUK3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cln8Q9QUK3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cln8Q9QUK3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cln8Q9QUK3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cln8Q9QUK3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cln8Q9QUK3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cln8Q9QUK3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cln8Q9QUK3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cln8Q9QUK3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cln8Q9QUK3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cln8Q9QUK3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cln8Q9QUK3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cln8Q9QUK3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cln8Q9QUK3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cln8Q9QUK3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cln8Q9QUK3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cln8Q9QUK3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cln8Q9QUK3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cln8Q9QUK3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cln8Q9QUK3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cln8Q9QUK3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cln8Q9QUK3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cln8Q9QUK3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cln8Q9QUK3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cln8Q9QUK3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cln8Q9QUK3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cln8Q9QUK3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cln8Q9QUK3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cln8Q9QUK3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cln8Q9QUK3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cln8Q9QUK3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cln8Q9QUK3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cln8Q9QUK3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cln8Q9QUK3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cln8Q9QUK3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms