Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Stx6Q9JKK1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Stx6Q9JKK1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Stx6Q9JKK1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Stx6Q9JKK1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Stx6Q9JKK1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Stx6Q9JKK1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Stx6Q9JKK1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Stx6Q9JKK1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Stx6Q9JKK1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stx6Q9JKK1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stx6Q9JKK1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Stx6Q9JKK1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Stx6Q9JKK1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Stx6Q9JKK1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Stx6Q9JKK1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Stx6Q9JKK1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Stx6Q9JKK1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Stx6Q9JKK1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stx6Q9JKK1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stx6Q9JKK1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Stx6Q9JKK1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Stx6Q9JKK1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Stx6Q9JKK1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Stx6Q9JKK1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Stx6Q9JKK1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Stx6Q9JKK1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stx6Q9JKK1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stx6Q9JKK1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Stx6Q9JKK1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Stx6Q9JKK1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Stx6Q9JKK1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stx6Q9JKK1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stx6Q9JKK1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Stx6Q9JKK1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Stx6Q9JKK1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stx6Q9JKK1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Stx6Q9JKK1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Stx6Q9JKK1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Stx6Q9JKK1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Stx6Q9JKK1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Stx6Q9JKK1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Stx6Q9JKK1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Stx6Q9JKK1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Stx6Q9JKK1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Stx6Q9JKK1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Stx6Q9JKK1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Stx6Q9JKK1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stx6Q9JKK1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stx6Q9JKK1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stx6Q9JKK1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stx6Q9JKK1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Stx6Q9JKK1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Stx6Q9JKK1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stx6Q9JKK1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stx6Q9JKK1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stx6Q9JKK1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stx6Q9JKK1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stx6Q9JKK1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stx6Q9JKK1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stx6Q9JKK1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Stx6Q9JKK1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Stx6Q9JKK1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Stx6Q9JKK1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Stx6Q9JKK1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Stx6Q9JKK1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Stx6Q9JKK1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Stx6Q9JKK1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Stx6Q9JKK1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Stx6Q9JKK1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Stx6Q9JKK1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Stx6Q9JKK1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Stx6Q9JKK1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Stx6Q9JKK1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Stx6Q9JKK1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Stx6Q9JKK1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Stx6Q9JKK1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Stx6Q9JKK1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Stx6Q9JKK1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Stx6Q9JKK1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stx6Q9JKK1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stx6Q9JKK1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stx6Q9JKK1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stx6Q9JKK1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stx6Q9JKK1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stx6Q9JKK1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stx6Q9JKK1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stx6Q9JKK1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stx6Q9JKK1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stx6Q9JKK1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Stx6Q9JKK1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Stx6Q9JKK1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Stx6Q9JKK1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stx6Q9JKK1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stx6Q9JKK1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Stx6Q9JKK1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Stx6Q9JKK1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Stx6Q9JKK1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Stx6Q9JKK1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Stx6Q9JKK1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms