Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA1

Lgi1, Leucine-rich glioma-inactivated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi1Q9JIA1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lgi1Q9JIA1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lgi1Q9JIA1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lgi1Q9JIA1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lgi1Q9JIA1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lgi1Q9JIA1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lgi1Q9JIA1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lgi1Q9JIA1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lgi1Q9JIA1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lgi1Q9JIA1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lgi1Q9JIA1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lgi1Q9JIA1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lgi1Q9JIA1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lgi1Q9JIA1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lgi1Q9JIA1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lgi1Q9JIA1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lgi1Q9JIA1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lgi1Q9JIA1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lgi1Q9JIA1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lgi1Q9JIA1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lgi1Q9JIA1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lgi1Q9JIA1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lgi1Q9JIA1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lgi1Q9JIA1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lgi1Q9JIA1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lgi1Q9JIA1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lgi1Q9JIA1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lgi1Q9JIA1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lgi1Q9JIA1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lgi1Q9JIA1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lgi1Q9JIA1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lgi1Q9JIA1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lgi1Q9JIA1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lgi1Q9JIA1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lgi1Q9JIA1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lgi1Q9JIA1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lgi1Q9JIA1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lgi1Q9JIA1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lgi1Q9JIA1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lgi1Q9JIA1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lgi1Q9JIA1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lgi1Q9JIA1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lgi1Q9JIA1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lgi1Q9JIA1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lgi1Q9JIA1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lgi1Q9JIA1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lgi1Q9JIA1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lgi1Q9JIA1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lgi1Q9JIA1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lgi1Q9JIA1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lgi1Q9JIA1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lgi1Q9JIA1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lgi1Q9JIA1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lgi1Q9JIA1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lgi1Q9JIA1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lgi1Q9JIA1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lgi1Q9JIA1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lgi1Q9JIA1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lgi1Q9JIA1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lgi1Q9JIA1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lgi1Q9JIA1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lgi1Q9JIA1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lgi1Q9JIA1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lgi1Q9JIA1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lgi1Q9JIA1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lgi1Q9JIA1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lgi1Q9JIA1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lgi1Q9JIA1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lgi1Q9JIA1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lgi1Q9JIA1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lgi1Q9JIA1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lgi1Q9JIA1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lgi1Q9JIA1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lgi1Q9JIA1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lgi1Q9JIA1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lgi1Q9JIA1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lgi1Q9JIA1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lgi1Q9JIA1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lgi1Q9JIA1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lgi1Q9JIA1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lgi1Q9JIA1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lgi1Q9JIA1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lgi1Q9JIA1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lgi1Q9JIA1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lgi1Q9JIA1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lgi1Q9JIA1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lgi1Q9JIA1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lgi1Q9JIA1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lgi1Q9JIA1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lgi1Q9JIA1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lgi1Q9JIA1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lgi1Q9JIA1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lgi1Q9JIA1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lgi1Q9JIA1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lgi1Q9JIA1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lgi1Q9JIA1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lgi1Q9JIA1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lgi1Q9JIA1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lgi1Q9JIA1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lgi1Q9JIA1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms