Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI9

Slc40a1, Solute carrier family 40 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc40a1Q9JHI9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc40a1Q9JHI9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc40a1Q9JHI9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc40a1Q9JHI9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc40a1Q9JHI9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc40a1Q9JHI9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc40a1Q9JHI9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc40a1Q9JHI9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc40a1Q9JHI9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc40a1Q9JHI9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc40a1Q9JHI9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc40a1Q9JHI9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc40a1Q9JHI9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc40a1Q9JHI9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc40a1Q9JHI9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Slc40a1Q9JHI9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc40a1Q9JHI9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc40a1Q9JHI9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc40a1Q9JHI9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc40a1Q9JHI9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc40a1Q9JHI9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc40a1Q9JHI9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc40a1Q9JHI9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc40a1Q9JHI9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc40a1Q9JHI9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc40a1Q9JHI9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc40a1Q9JHI9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc40a1Q9JHI9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc40a1Q9JHI9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc40a1Q9JHI9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc40a1Q9JHI9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc40a1Q9JHI9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc40a1Q9JHI9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc40a1Q9JHI9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc40a1Q9JHI9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc40a1Q9JHI9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc40a1Q9JHI9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc40a1Q9JHI9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc40a1Q9JHI9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc40a1Q9JHI9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc40a1Q9JHI9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc40a1Q9JHI9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc40a1Q9JHI9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc40a1Q9JHI9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc40a1Q9JHI9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc40a1Q9JHI9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc40a1Q9JHI9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc40a1Q9JHI9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc40a1Q9JHI9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc40a1Q9JHI9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc40a1Q9JHI9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc40a1Q9JHI9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc40a1Q9JHI9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc40a1Q9JHI9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc40a1Q9JHI9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc40a1Q9JHI9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc40a1Q9JHI9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc40a1Q9JHI9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc40a1Q9JHI9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc40a1Q9JHI9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc40a1Q9JHI9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc40a1Q9JHI9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc40a1Q9JHI9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc40a1Q9JHI9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc40a1Q9JHI9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc40a1Q9JHI9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc40a1Q9JHI9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc40a1Q9JHI9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc40a1Q9JHI9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc40a1Q9JHI9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc40a1Q9JHI9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc40a1Q9JHI9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc40a1Q9JHI9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc40a1Q9JHI9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc40a1Q9JHI9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc40a1Q9JHI9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc40a1Q9JHI9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc40a1Q9JHI9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc40a1Q9JHI9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc40a1Q9JHI9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc40a1Q9JHI9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc40a1Q9JHI9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc40a1Q9JHI9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc40a1Q9JHI9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc40a1Q9JHI9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc40a1Q9JHI9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc40a1Q9JHI9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc40a1Q9JHI9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc40a1Q9JHI9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc40a1Q9JHI9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc40a1Q9JHI9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc40a1Q9JHI9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc40a1Q9JHI9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc40a1Q9JHI9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc40a1Q9JHI9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc40a1Q9JHI9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc40a1Q9JHI9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc40a1Q9JHI9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc40a1Q9JHI9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc40a1Q9JHI9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms