Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tcirg1Q9JHF5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tcirg1Q9JHF5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tcirg1Q9JHF5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tcirg1Q9JHF5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tcirg1Q9JHF5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tcirg1Q9JHF5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tcirg1Q9JHF5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tcirg1Q9JHF5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tcirg1Q9JHF5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tcirg1Q9JHF5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tcirg1Q9JHF5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tcirg1Q9JHF5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tcirg1Q9JHF5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tcirg1Q9JHF5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tcirg1Q9JHF5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tcirg1Q9JHF5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tcirg1Q9JHF5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tcirg1Q9JHF5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tcirg1Q9JHF5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tcirg1Q9JHF5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tcirg1Q9JHF5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tcirg1Q9JHF5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tcirg1Q9JHF5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tcirg1Q9JHF5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tcirg1Q9JHF5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tcirg1Q9JHF5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tcirg1Q9JHF5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tcirg1Q9JHF5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tcirg1Q9JHF5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tcirg1Q9JHF5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tcirg1Q9JHF5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tcirg1Q9JHF5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tcirg1Q9JHF5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tcirg1Q9JHF5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tcirg1Q9JHF5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tcirg1Q9JHF5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tcirg1Q9JHF5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tcirg1Q9JHF5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tcirg1Q9JHF5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tcirg1Q9JHF5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tcirg1Q9JHF5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tcirg1Q9JHF5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tcirg1Q9JHF5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tcirg1Q9JHF5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tcirg1Q9JHF5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tcirg1Q9JHF5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tcirg1Q9JHF5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tcirg1Q9JHF5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tcirg1Q9JHF5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tcirg1Q9JHF5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tcirg1Q9JHF5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tcirg1Q9JHF5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tcirg1Q9JHF5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Tcirg1Q9JHF5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tcirg1Q9JHF5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tcirg1Q9JHF5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tcirg1Q9JHF5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tcirg1Q9JHF5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tcirg1Q9JHF5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tcirg1Q9JHF5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tcirg1Q9JHF5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tcirg1Q9JHF5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tcirg1Q9JHF5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tcirg1Q9JHF5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tcirg1Q9JHF5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tcirg1Q9JHF5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tcirg1Q9JHF5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tcirg1Q9JHF5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tcirg1Q9JHF5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tcirg1Q9JHF5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tcirg1Q9JHF5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tcirg1Q9JHF5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tcirg1Q9JHF5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tcirg1Q9JHF5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tcirg1Q9JHF5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tcirg1Q9JHF5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tcirg1Q9JHF5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tcirg1Q9JHF5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tcirg1Q9JHF5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tcirg1Q9JHF5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tcirg1Q9JHF5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tcirg1Q9JHF5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tcirg1Q9JHF5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tcirg1Q9JHF5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcirg1Q9JHF5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcirg1Q9JHF5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcirg1Q9JHF5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcirg1Q9JHF5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcirg1Q9JHF5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcirg1Q9JHF5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcirg1Q9JHF5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tcirg1Q9JHF5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tcirg1Q9JHF5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tcirg1Q9JHF5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tcirg1Q9JHF5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tcirg1Q9JHF5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tcirg1Q9JHF5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tcirg1Q9JHF5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms