Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrnb2Q9ERK7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrnb2Q9ERK7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrnb2Q9ERK7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrnb2Q9ERK7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrnb2Q9ERK7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrnb2Q9ERK7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrnb2Q9ERK7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrnb2Q9ERK7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrnb2Q9ERK7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrnb2Q9ERK7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrnb2Q9ERK7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrnb2Q9ERK7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrnb2Q9ERK7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrnb2Q9ERK7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrnb2Q9ERK7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrnb2Q9ERK7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chrnb2Q9ERK7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrnb2Q9ERK7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrnb2Q9ERK7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrnb2Q9ERK7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chrnb2Q9ERK7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chrnb2Q9ERK7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chrnb2Q9ERK7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrnb2Q9ERK7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrnb2Q9ERK7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrnb2Q9ERK7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chrnb2Q9ERK7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrnb2Q9ERK7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrnb2Q9ERK7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrnb2Q9ERK7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrnb2Q9ERK7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrnb2Q9ERK7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrnb2Q9ERK7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrnb2Q9ERK7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrnb2Q9ERK7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrnb2Q9ERK7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrnb2Q9ERK7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrnb2Q9ERK7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrnb2Q9ERK7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrnb2Q9ERK7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrnb2Q9ERK7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrnb2Q9ERK7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrnb2Q9ERK7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrnb2Q9ERK7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrnb2Q9ERK7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrnb2Q9ERK7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrnb2Q9ERK7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrnb2Q9ERK7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrnb2Q9ERK7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrnb2Q9ERK7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrnb2Q9ERK7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrnb2Q9ERK7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrnb2Q9ERK7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrnb2Q9ERK7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrnb2Q9ERK7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrnb2Q9ERK7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrnb2Q9ERK7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrnb2Q9ERK7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrnb2Q9ERK7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrnb2Q9ERK7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrnb2Q9ERK7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrnb2Q9ERK7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrnb2Q9ERK7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrnb2Q9ERK7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrnb2Q9ERK7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrnb2Q9ERK7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrnb2Q9ERK7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrnb2Q9ERK7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrnb2Q9ERK7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrnb2Q9ERK7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrnb2Q9ERK7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrnb2Q9ERK7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrnb2Q9ERK7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrnb2Q9ERK7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrnb2Q9ERK7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrnb2Q9ERK7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrnb2Q9ERK7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrnb2Q9ERK7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrnb2Q9ERK7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrnb2Q9ERK7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrnb2Q9ERK7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrnb2Q9ERK7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrnb2Q9ERK7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrnb2Q9ERK7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrnb2Q9ERK7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrnb2Q9ERK7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrnb2Q9ERK7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrnb2Q9ERK7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrnb2Q9ERK7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrnb2Q9ERK7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrnb2Q9ERK7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrnb2Q9ERK7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrnb2Q9ERK7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrnb2Q9ERK7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrnb2Q9ERK7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrnb2Q9ERK7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrnb2Q9ERK7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrnb2Q9ERK7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms