Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Clstn2Q9ER65 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Clstn2Q9ER65 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Clstn2Q9ER65 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Clstn2Q9ER65 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Clstn2Q9ER65 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Clstn2Q9ER65 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Clstn2Q9ER65 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Clstn2Q9ER65 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Clstn2Q9ER65 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Clstn2Q9ER65 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Clstn2Q9ER65 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Clstn2Q9ER65 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Clstn2Q9ER65 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Clstn2Q9ER65 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Clstn2Q9ER65 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Clstn2Q9ER65 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Clstn2Q9ER65 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Clstn2Q9ER65 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Clstn2Q9ER65 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Clstn2Q9ER65 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Clstn2Q9ER65 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Clstn2Q9ER65 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Clstn2Q9ER65 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Clstn2Q9ER65 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Clstn2Q9ER65 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Clstn2Q9ER65 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Clstn2Q9ER65 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Clstn2Q9ER65 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Clstn2Q9ER65 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Clstn2Q9ER65 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Clstn2Q9ER65 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
Clstn2Q9ER65 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Clstn2Q9ER65 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Clstn2Q9ER65 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Clstn2Q9ER65 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Clstn2Q9ER65 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Clstn2Q9ER65 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Clstn2Q9ER65 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Clstn2Q9ER65 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Clstn2Q9ER65 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Clstn2Q9ER65 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Clstn2Q9ER65 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Clstn2Q9ER65 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Clstn2Q9ER65 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Clstn2Q9ER65 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Clstn2Q9ER65 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Clstn2Q9ER65 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Clstn2Q9ER65 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Clstn2Q9ER65 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Clstn2Q9ER65 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Clstn2Q9ER65 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
Clstn2Q9ER65 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Clstn2Q9ER65 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Clstn2Q9ER65 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
Clstn2Q9ER65 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Clstn2Q9ER65 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Clstn2Q9ER65 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Clstn2Q9ER65 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Clstn2Q9ER65 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Clstn2Q9ER65 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Clstn2Q9ER65 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Clstn2Q9ER65 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Clstn2Q9ER65 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Clstn2Q9ER65 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Clstn2Q9ER65 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Clstn2Q9ER65 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Clstn2Q9ER65 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Clstn2Q9ER65 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Clstn2Q9ER65 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Clstn2Q9ER65 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Clstn2Q9ER65 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Clstn2Q9ER65 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Clstn2Q9ER65 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Clstn2Q9ER65 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Clstn2Q9ER65 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Clstn2Q9ER65 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Clstn2Q9ER65 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Clstn2Q9ER65 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Clstn2Q9ER65 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Clstn2Q9ER65 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Clstn2Q9ER65 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Clstn2Q9ER65 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Clstn2Q9ER65 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Clstn2Q9ER65 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Clstn2Q9ER65 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Clstn2Q9ER65 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Clstn2Q9ER65 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Clstn2Q9ER65 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Clstn2Q9ER65 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Clstn2Q9ER65 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Clstn2Q9ER65 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Clstn2Q9ER65 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Clstn2Q9ER65 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Clstn2Q9ER65 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Clstn2Q9ER65 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Clstn2Q9ER65 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Clstn2Q9ER65 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Clstn2Q9ER65 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Clstn2Q9ER65 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms