Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tlr9Q9EQU3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tlr9Q9EQU3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tlr9Q9EQU3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tlr9Q9EQU3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tlr9Q9EQU3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tlr9Q9EQU3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tlr9Q9EQU3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tlr9Q9EQU3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tlr9Q9EQU3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tlr9Q9EQU3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tlr9Q9EQU3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tlr9Q9EQU3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tlr9Q9EQU3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tlr9Q9EQU3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tlr9Q9EQU3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tlr9Q9EQU3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tlr9Q9EQU3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tlr9Q9EQU3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tlr9Q9EQU3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tlr9Q9EQU3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tlr9Q9EQU3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tlr9Q9EQU3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tlr9Q9EQU3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tlr9Q9EQU3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tlr9Q9EQU3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tlr9Q9EQU3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tlr9Q9EQU3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tlr9Q9EQU3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tlr9Q9EQU3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tlr9Q9EQU3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tlr9Q9EQU3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tlr9Q9EQU3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tlr9Q9EQU3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tlr9Q9EQU3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tlr9Q9EQU3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tlr9Q9EQU3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tlr9Q9EQU3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tlr9Q9EQU3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tlr9Q9EQU3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tlr9Q9EQU3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tlr9Q9EQU3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tlr9Q9EQU3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tlr9Q9EQU3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tlr9Q9EQU3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tlr9Q9EQU3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tlr9Q9EQU3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tlr9Q9EQU3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tlr9Q9EQU3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tlr9Q9EQU3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tlr9Q9EQU3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Tlr9Q9EQU3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tlr9Q9EQU3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tlr9Q9EQU3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tlr9Q9EQU3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tlr9Q9EQU3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tlr9Q9EQU3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tlr9Q9EQU3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tlr9Q9EQU3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tlr9Q9EQU3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tlr9Q9EQU3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tlr9Q9EQU3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tlr9Q9EQU3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tlr9Q9EQU3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tlr9Q9EQU3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tlr9Q9EQU3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tlr9Q9EQU3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tlr9Q9EQU3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tlr9Q9EQU3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tlr9Q9EQU3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tlr9Q9EQU3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tlr9Q9EQU3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tlr9Q9EQU3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tlr9Q9EQU3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tlr9Q9EQU3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tlr9Q9EQU3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tlr9Q9EQU3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tlr9Q9EQU3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tlr9Q9EQU3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tlr9Q9EQU3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tlr9Q9EQU3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tlr9Q9EQU3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tlr9Q9EQU3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tlr9Q9EQU3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tlr9Q9EQU3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tlr9Q9EQU3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tlr9Q9EQU3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tlr9Q9EQU3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tlr9Q9EQU3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tlr9Q9EQU3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tlr9Q9EQU3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tlr9Q9EQU3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tlr9Q9EQU3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tlr9Q9EQU3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tlr9Q9EQU3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tlr9Q9EQU3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tlr9Q9EQU3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tlr9Q9EQU3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tlr9Q9EQU3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tlr9Q9EQU3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms