Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC61

Pmpca, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, mousemouse

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Length 524 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcaQ9DC61 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PmpcaQ9DC61 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PmpcaQ9DC61 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PmpcaQ9DC61 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PmpcaQ9DC61 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PmpcaQ9DC61 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PmpcaQ9DC61 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PmpcaQ9DC61 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PmpcaQ9DC61 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PmpcaQ9DC61 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PmpcaQ9DC61 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PmpcaQ9DC61 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PmpcaQ9DC61 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PmpcaQ9DC61 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PmpcaQ9DC61 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PmpcaQ9DC61 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PmpcaQ9DC61 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PmpcaQ9DC61 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PmpcaQ9DC61 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PmpcaQ9DC61 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PmpcaQ9DC61 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PmpcaQ9DC61 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PmpcaQ9DC61 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PmpcaQ9DC61 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PmpcaQ9DC61 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PmpcaQ9DC61 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PmpcaQ9DC61 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PmpcaQ9DC61 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PmpcaQ9DC61 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PmpcaQ9DC61 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PmpcaQ9DC61 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PmpcaQ9DC61 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PmpcaQ9DC61 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PmpcaQ9DC61 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PmpcaQ9DC61 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PmpcaQ9DC61 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PmpcaQ9DC61 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PmpcaQ9DC61 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PmpcaQ9DC61 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PmpcaQ9DC61 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PmpcaQ9DC61 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PmpcaQ9DC61 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PmpcaQ9DC61 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PmpcaQ9DC61 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PmpcaQ9DC61 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PmpcaQ9DC61 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PmpcaQ9DC61 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PmpcaQ9DC61 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PmpcaQ9DC61 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PmpcaQ9DC61 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PmpcaQ9DC61 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PmpcaQ9DC61 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PmpcaQ9DC61 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PmpcaQ9DC61 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PmpcaQ9DC61 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PmpcaQ9DC61 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PmpcaQ9DC61 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PmpcaQ9DC61 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PmpcaQ9DC61 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PmpcaQ9DC61 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PmpcaQ9DC61 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PmpcaQ9DC61 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PmpcaQ9DC61 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PmpcaQ9DC61 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PmpcaQ9DC61 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PmpcaQ9DC61 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PmpcaQ9DC61 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PmpcaQ9DC61 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PmpcaQ9DC61 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PmpcaQ9DC61 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PmpcaQ9DC61 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PmpcaQ9DC61 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PmpcaQ9DC61 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PmpcaQ9DC61 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PmpcaQ9DC61 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PmpcaQ9DC61 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PmpcaQ9DC61 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PmpcaQ9DC61 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PmpcaQ9DC61 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PmpcaQ9DC61 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PmpcaQ9DC61 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PmpcaQ9DC61 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PmpcaQ9DC61 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PmpcaQ9DC61 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PmpcaQ9DC61 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PmpcaQ9DC61 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PmpcaQ9DC61 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PmpcaQ9DC61 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PmpcaQ9DC61 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PmpcaQ9DC61 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PmpcaQ9DC61 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PmpcaQ9DC61 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PmpcaQ9DC61 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PmpcaQ9DC61 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PmpcaQ9DC61 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PmpcaQ9DC61 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PmpcaQ9DC61 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PmpcaQ9DC61 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PmpcaQ9DC61 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PmpcaQ9DC61 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183.3 ms