Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBS1

Tmem43, Transmembrane protein 43, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem43Q9DBS1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem43Q9DBS1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem43Q9DBS1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem43Q9DBS1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem43Q9DBS1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem43Q9DBS1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem43Q9DBS1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem43Q9DBS1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem43Q9DBS1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem43Q9DBS1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem43Q9DBS1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem43Q9DBS1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem43Q9DBS1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem43Q9DBS1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem43Q9DBS1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem43Q9DBS1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tmem43Q9DBS1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem43Q9DBS1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem43Q9DBS1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem43Q9DBS1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem43Q9DBS1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem43Q9DBS1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem43Q9DBS1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem43Q9DBS1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem43Q9DBS1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem43Q9DBS1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem43Q9DBS1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem43Q9DBS1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem43Q9DBS1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem43Q9DBS1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem43Q9DBS1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem43Q9DBS1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem43Q9DBS1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem43Q9DBS1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem43Q9DBS1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem43Q9DBS1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem43Q9DBS1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem43Q9DBS1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem43Q9DBS1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem43Q9DBS1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmem43Q9DBS1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmem43Q9DBS1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem43Q9DBS1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem43Q9DBS1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem43Q9DBS1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem43Q9DBS1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem43Q9DBS1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem43Q9DBS1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem43Q9DBS1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem43Q9DBS1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem43Q9DBS1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem43Q9DBS1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem43Q9DBS1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem43Q9DBS1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem43Q9DBS1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem43Q9DBS1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem43Q9DBS1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tmem43Q9DBS1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem43Q9DBS1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms