Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cyp27a1Q9DBG1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cyp27a1Q9DBG1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cyp27a1Q9DBG1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cyp27a1Q9DBG1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cyp27a1Q9DBG1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cyp27a1Q9DBG1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cyp27a1Q9DBG1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cyp27a1Q9DBG1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cyp27a1Q9DBG1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cyp27a1Q9DBG1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cyp27a1Q9DBG1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cyp27a1Q9DBG1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cyp27a1Q9DBG1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cyp27a1Q9DBG1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cyp27a1Q9DBG1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cyp27a1Q9DBG1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cyp27a1Q9DBG1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cyp27a1Q9DBG1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cyp27a1Q9DBG1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cyp27a1Q9DBG1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cyp27a1Q9DBG1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cyp27a1Q9DBG1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cyp27a1Q9DBG1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cyp27a1Q9DBG1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cyp27a1Q9DBG1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cyp27a1Q9DBG1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cyp27a1Q9DBG1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cyp27a1Q9DBG1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cyp27a1Q9DBG1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cyp27a1Q9DBG1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cyp27a1Q9DBG1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cyp27a1Q9DBG1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Cyp27a1Q9DBG1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cyp27a1Q9DBG1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Cyp27a1Q9DBG1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cyp27a1Q9DBG1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cyp27a1Q9DBG1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cyp27a1Q9DBG1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cyp27a1Q9DBG1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cyp27a1Q9DBG1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cyp27a1Q9DBG1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cyp27a1Q9DBG1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cyp27a1Q9DBG1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cyp27a1Q9DBG1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cyp27a1Q9DBG1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cyp27a1Q9DBG1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cyp27a1Q9DBG1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cyp27a1Q9DBG1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Cyp27a1Q9DBG1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Cyp27a1Q9DBG1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cyp27a1Q9DBG1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cyp27a1Q9DBG1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cyp27a1Q9DBG1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Cyp27a1Q9DBG1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cyp27a1Q9DBG1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cyp27a1Q9DBG1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cyp27a1Q9DBG1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cyp27a1Q9DBG1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cyp27a1Q9DBG1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cyp27a1Q9DBG1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cyp27a1Q9DBG1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cyp27a1Q9DBG1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cyp27a1Q9DBG1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cyp27a1Q9DBG1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cyp27a1Q9DBG1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cyp27a1Q9DBG1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cyp27a1Q9DBG1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cyp27a1Q9DBG1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cyp27a1Q9DBG1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cyp27a1Q9DBG1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cyp27a1Q9DBG1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cyp27a1Q9DBG1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cyp27a1Q9DBG1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cyp27a1Q9DBG1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cyp27a1Q9DBG1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cyp27a1Q9DBG1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cyp27a1Q9DBG1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cyp27a1Q9DBG1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cyp27a1Q9DBG1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cyp27a1Q9DBG1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cyp27a1Q9DBG1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cyp27a1Q9DBG1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cyp27a1Q9DBG1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cyp27a1Q9DBG1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cyp27a1Q9DBG1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cyp27a1Q9DBG1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cyp27a1Q9DBG1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cyp27a1Q9DBG1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Cyp27a1Q9DBG1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cyp27a1Q9DBG1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cyp27a1Q9DBG1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cyp27a1Q9DBG1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cyp27a1Q9DBG1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cyp27a1Q9DBG1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cyp27a1Q9DBG1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cyp27a1Q9DBG1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cyp27a1Q9DBG1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cyp27a1Q9DBG1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms