Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC7

Prkar1a, cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkar1aQ9DBC7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkar1aQ9DBC7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkar1aQ9DBC7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prkar1aQ9DBC7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prkar1aQ9DBC7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkar1aQ9DBC7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkar1aQ9DBC7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkar1aQ9DBC7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkar1aQ9DBC7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkar1aQ9DBC7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkar1aQ9DBC7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkar1aQ9DBC7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkar1aQ9DBC7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkar1aQ9DBC7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkar1aQ9DBC7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkar1aQ9DBC7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkar1aQ9DBC7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkar1aQ9DBC7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkar1aQ9DBC7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkar1aQ9DBC7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkar1aQ9DBC7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkar1aQ9DBC7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkar1aQ9DBC7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkar1aQ9DBC7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkar1aQ9DBC7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkar1aQ9DBC7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkar1aQ9DBC7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkar1aQ9DBC7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prkar1aQ9DBC7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prkar1aQ9DBC7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Prkar1aQ9DBC7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prkar1aQ9DBC7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Prkar1aQ9DBC7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkar1aQ9DBC7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Prkar1aQ9DBC7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prkar1aQ9DBC7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkar1aQ9DBC7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prkar1aQ9DBC7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prkar1aQ9DBC7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prkar1aQ9DBC7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prkar1aQ9DBC7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prkar1aQ9DBC7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prkar1aQ9DBC7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prkar1aQ9DBC7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prkar1aQ9DBC7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkar1aQ9DBC7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkar1aQ9DBC7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkar1aQ9DBC7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prkar1aQ9DBC7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prkar1aQ9DBC7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prkar1aQ9DBC7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prkar1aQ9DBC7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkar1aQ9DBC7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkar1aQ9DBC7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prkar1aQ9DBC7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prkar1aQ9DBC7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prkar1aQ9DBC7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prkar1aQ9DBC7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkar1aQ9DBC7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkar1aQ9DBC7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkar1aQ9DBC7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkar1aQ9DBC7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkar1aQ9DBC7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkar1aQ9DBC7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkar1aQ9DBC7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkar1aQ9DBC7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkar1aQ9DBC7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkar1aQ9DBC7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prkar1aQ9DBC7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prkar1aQ9DBC7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Prkar1aQ9DBC7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkar1aQ9DBC7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkar1aQ9DBC7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prkar1aQ9DBC7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prkar1aQ9DBC7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prkar1aQ9DBC7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prkar1aQ9DBC7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prkar1aQ9DBC7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prkar1aQ9DBC7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkar1aQ9DBC7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkar1aQ9DBC7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkar1aQ9DBC7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prkar1aQ9DBC7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prkar1aQ9DBC7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prkar1aQ9DBC7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prkar1aQ9DBC7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prkar1aQ9DBC7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prkar1aQ9DBC7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prkar1aQ9DBC7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Prkar1aQ9DBC7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prkar1aQ9DBC7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prkar1aQ9DBC7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prkar1aQ9DBC7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prkar1aQ9DBC7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prkar1aQ9DBC7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prkar1aQ9DBC7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prkar1aQ9DBC7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkar1aQ9DBC7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkar1aQ9DBC7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkar1aQ9DBC7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms